Studium změny exprese genů zapojených v odpovědi na poškození DNA

Bc. Šárka RYPIENOVÁ

Master's thesis

Studying of alternation in gene expression of DNA damage response genes

Abstract:

Předkládaná diplomová práce je zaměřena na zavedení metody real-time PCR pro detekci genů zapojených v odpovědi na poškozenou DNA u Saccharomyces cerevisiae. Konkrétně jde o geny RAD51, YKU70, RAD4, BXI1 a RAD27. Gen RAD51 je využíván v rámci oprav dvouřetězcových zlomů pomocí homologní rekombinace. Gen YKU70 je také potřebný pro opravu dvouřetězcových zlomů, ale prostřednictvím nehomologního spojování konců. Gen RAD4 je využíván během nukleotidové excizní reparace a gen RAD27 během bázové excizní reparace. Pro sledování apoptotická dráhy byl vybrán gen BXI1. V této práci byla sledována exprese jednotlivých genů pomocí relativní kvantifikace u vzorků Saccharomyces cerevisiae, které byly ovlivněny látkou ethylmethansulfonát.

Abstract:

This thesis is focused on the implementation of real-time PCR method for detection genes involved in DNA damage response in Saccharomyces cerevisiae. Specifically, genes RAD51, YKU70, RAD4, BXI1 and RAD27. RAD51 gene is used in the repair of DSBs by homologous recombination. YKU70 gene is also needed for the repair of DSBs but through non-homologous end joining. RAD4 gene is used during nucleotide excision repair and RAD27 gene during base excision repair. To observe the apoptotic pathway was selected BXI1 gene. In this thesis was studied gene expression by relative quantification in samples of Saccharomyces cerevisiae which have been affected by ethyl methansulfonate.

Keywords

poškození DNA, RAD51, YKU70, RAD4, BXI1, RAD27, ethylmethansulfonát, real-time PCR

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 6. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 22. 8. 2016
• Supervisor: Mgr. Jiří Červeň

University of Ostrava

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Experimental Biology