Vliv vnějších ekologických faktorů na diverzitu mykobakterií u netopýra velkého (Myotis myotis)

Bc. Michal Kotúč

Master's thesis

Impact of external ecological factors on mycobacteria diversity in the Greater mouse-eared bat (Myotis myotis)

Abstract:

Mykobakterie jsou přítomny kdekoli na světě, dokonce i v jeskyních, půdě, vodě, prachu a koexistují i uvnitř organismů, netopýry nevyjímaje. Přestože jsou tak kos-mopolitní a některé kmeny jsou patogenní a způsobují vážné následky u zvířat a lidí, mnoho informací o jejich existenci chybí. Tato studie poskytuje určité poznatky o tom, které faktory prostředí by mohly mít vliv na přítomnost některých druhů my-kobakterií u netopýrů. Netopýří guáno jsem použil jako proxy jejich přítomnosti u netopýrů. Vzorky guána byly odebírány v průběhu června až července v letech 2020 a 2021 z 68 letních sta-novišť druhu Myotis myotis, rozptýlených po celé České republice. Pozitivita vzorků na přítomnost mykobakterií byla hodnocena přímou mikroskopií po Ziehl–Neelsen barvení, kultivací a vyšetřením rastu kolonií a metodou kvantitativní qPCR. Využil jsem vícero environmentálních faktorů, které by mohly mít vliv na přítomnost druhů mykobakterií, a to pomocí softwaru GIS a geochemické analýzy prvků. Získa-né proměnné pro každou lokalitu netopýrů jsem vynesl do statistických analýz a porovnával je jako pozitivní a negativní na přítomnost mykobakterií. Výsledky uka-zují určitý vliv přítomnosti těžkých kovů, což naznačuje, že netopýři ve znečištěných lokalitách jsou silněji zasaženy mykobakteriemi. Avšak podobné stanoviště, které si netopýr velký vybírá, nemají významný vliv na přítomnost mykobakterií.

Abstract:

Mycobacteria are present anywhere in the world even in caves, soil, water, and dust, and they also coexist inside organisms, not excluding bats. Though they are so cosmopolitan, and some strains are pathogenic causing serious losses and disease across animals and humans, a lot of information about their exist-ence is missing. This study provides some knowledge of which environmental factors could alter the presence of mycobacteria species in bats. I used bat guano as a proxy of their presence in bats. The guano samples were collected during June-July 2020 and 2021 years from 68 summer roosts of Myotis myotis dispersed throughout the Czech Republic. The positivity of samples on mycobacteria presence was evaluated by direct microscopy after Ziehl–Neelsen staining, culture growth examination, and quantitative qPCR method. I used many environmental factors that could alter the presence of myco-bacteria using GIS software and geochemical analysis of elements. The ac-quired variables for each bat locality were plotted in statistical analyses as my-cobacteria positive and negative groups. The results suggest some impact of present heavy metals, suggesting bats in polluted localities are more heavily in-fested with mycobacteria. However, similar habitats chosen by the Myotis myo-tis do not have a significant effect on the presence of mycobacteria.

Keywords

Chiroptera, netopýr, environmentální faktory, těžké kovy, netopýr velký, Myotis, prevalence, mykobakterie, analýza hlavních komponent

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 7. 2022

Thesis defence

• Date of defence: 6. 2. 2023
• Supervisor: doc. Mgr. Jan Zukal, Dr.
• Reader: RNDr. Ing. Veronika Seidlová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Zoology / Zoology