Studium cisplatinového derivátu pomocí nukleární magnetické rezonance (NMR), Ramanovou spektroskopii a teoretickými přístupy

Bc. Magdaléna Krejčíková

Master's thesis

Study of cisplatin derivatives using nuclear magnetic resonance (NMR), Raman spectroscopy and theoretical appraoches

Abstract:

Tato práce se zabývá studiem platonvými součeninami a jejich adukty, které tvoří s DNA molekulami. Hlavním tématem je vyřešení struktury krátkého oligonukleotidu s kovalentně navázanou slučeninou, kiteplatinou, pomocí nukleárně magnetické rezonance (NMR), rozptylu rentgenova záření pod malými úhly a teoretických výpočtů. V tomto projektu je také navržen postup, jak zkoumat adukty těchto platinových sloučenin přímo v buňce pomocí kombinace Ramanovy spektroskopie a kvantově mechanických výpočtů. V práci jsou provedeny výpočty vibračních spekter základních stavebních jednotek platinových aduktů a ty jsou porovnávány s experimentálními spektry.

Abstract:

This thesis is focused on the platinum compounds and their effects on DNA molecules. The main aim is to solve a structure of a short oligonucleotide cross-linked with a new potential platinum drug, kiteplatin. The adducts of platinum compounds with DNA could be studied directly in the cell, by the combinations of the Raman spectroscopy and the Density Functional Theory (DFT) calculations. The vibrational spectra of a building blocks of the platinum adduct are calculated in this thesis and they are compared with the experimental spectra.

Keywords

Cisplatina, Kiteplatina, DNA, Nuklearní magnetická resonance, SAXS, Molekulární dynamika, DFT, Ramanova spektroskopie, Cisplatin, Kiteplatin, Nuclear Magnetic Resonance, Small Angle X-Ray Scattering, Molecular dynamics, Raman spectroscopy

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 1. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 16. 2. 2016
• Supervisor: Mgr. Karel Kubíček, PhD.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Physics / Biophysics