Optimization Of Izolation Of RNA From Yeasts For The Purpose Of Transcription Analysis

Bc. Valin Lay

Diplomová práce

Abstract:

The diploma thesis deals with finding the optimal way to isolate RNA from different species of yeasts in the maximal possible amount and purity, especially from the non-pathogenic yeast (Saccharomyces cerevisiae) and pathogenic yeasts (Candida albicans and Candida parapsilosis). The theoretical section describes the basic information about these yeasts and utilization of transcriptomic analyses to study of their gene regulation. The characteristics of the PCR method, as well as its use for RNA transcription, are also mentioned. The practical section in the second part of the thesis contains partial steps of cultivation of different yeast species, RNA isolation using two different isolation methods (TRIzol reagent-phenol chloroform extraction and Quick-RNA Viral Kit), and the electrophoretic analysis of the obtained RNA.

Abstract:

Diplomová práce se zabývá nalezením optimálního způsobu izolace RNA z různých druhů kvasinek v maximálním možném množství a čistotě, zejména z nepatogenních kvasinek (Saccharomyces cerevisiae) a patogenních kvasinek (Candida albicans a Candida parapsilosis). V teoretické části jsou popsány základní informace o těchto kvasinkách a využití transkriptomických analýz ke studiu jejich genové regulace. Zmíněna je také charakteristika metody PCR a její použití pro transkripci RNA. Praktická část ve druhé části práce obsahuje dílčí kroky kultivace různých druhů kvasinek, izolaci RNA pomocí dvou různých izolačních metod (extrakční činidlo TRIzol-fenol chloroform a Quick-RNA Viral Kit) a elektroforetickou analýzu získané RNA.

Keywords

kvasinky, Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida parapsilosis, izolace RNA, transkripční analýza, PCR

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 5. 2023

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. Mgr. Roman Kanďár, Ph.D.

Univerzita Pardubice

Fakulta chemicko-technologická

Magisterský studijní program / obor:
Analýza biologických materiálů / Analýza biologických materiálů