Genetická typizace fytoplazmy stolburu v patosystému révy vinné

Romana Bukvová

Bachelor's thesis

Genetical typing of stolbur phytoplasma in the pathosystem of grapevine

Abstract:

Fytoplazmy jsou rostlinné patogeny, které byly objeveny v 60. letech minulého století. Jedná se o malé bakterie postrádající buněčnou stěnu, které parazitují v sítkovicích rostlin, u nichž způsobují výrazné škody. Jedním z důležitých zástupců fytoplazem je i fytoplazma stolburu, která infikuje i révu vinnou (Vitis vinifera L.) a způsobuje u ní chorobu označovanou jako Bois noir. Tato choroba, jejímž vektorem je žilnatka vironosná (Hyalesthes obsoletus Signoret), patří mezi nejrozšířenější fytoplazmové choroby révy na území Evropy. Pro šíření onemocnění Bois noir má velký význam výskyt fytoplazmy stolburu v rezervoárových rostlinách. Genetická variabilita mezi jednotlivými izoláty lišícími se svou specifitou k rezervoárové rostlině a k vektoru byla odhalena díky molekulárním metodám (PCR a RFLP analýza), které umožňují amplifikovat konkrétní variabilní úsek fytoplazmové DNA. Předložená bakalářská práce podává přehled o genetické variabilitě zjištěné u fytoplazmy stolburu na révě vinné na území Evropy, a to pomocí amplifikace genu tuf a vmp1 genu, které vykazují diverzitu mezi stolburovými izoláty. Experimentální část byla zaměřena na detekci a především na genetickou typizací fytoplazmy stolburu u příznakových rostlin révy vinné pocházejících z jižní Moravy. Genetická variabilita v genu tuf nebyla u stolburových izolátů zjištěna, zatímco vmp1 gen poskytl dva odlišné profily, přičemž jeden z profilů nebyl na révě dosud zjištěn

Abstract:

Phytoplasmas are plant pathogens that were discovered in the 60th in past century. They are small bacteria lacking cell wall which parasitize plant sieves and cause siignificant damages.One of the representative of phytoplasmas is Potato stolbur phytoplasma which infects grapevine (Vitis vinifera L.) and causes the disease known as Bois noir. This disease is transmitted by leafhopper (Hyalesthes obsoletus Signoret) and it is the most widespread disease among grapevine yellows in Europe. For the spread of Bois noir is also important the presence of stolbur phytoplasma in reservoir plants. Genetic diversity among isolates with different hostplant´s and vector´s specifity was detected by molecular methods (PCR and RFLP analyse) which allow amplification of specific phytoplasmas´ DNA sequence. This bachelor thesis gives an overview of the genetic variability found in bois noir phytoplasma in Europe by amplification of the tuf and vmp1 genes which shows the variation among stolbur isolates. The experimental part was focused on the detection and especially genetic typing of stolbur phytoplasma in symptomatic grapevines from south Moravia. Genetic diversity in the tuf gene wasn´t found, while the vmp1 gene has provided two different profiles among stolbur isolates and one of the profiles was not detected in grapevine until now

Keywords

fytoplazma stolburu, tuf gen, vmp1 gen, PCR, RFLP

Keywords

stolbur phytoplasma, tuf gene, vmp1 gene, PCR, RFLP

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 5. 2010

Thesis defence

• Date of defence: 3. 6. 2010
• Supervisor: Pavla Válová
• Reader: Milan Navrátil

Univerzita Palackého

Přírodovědecká fakulta

Bachelor programme / field:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie