Mgr. Miroslav Jurásek, Ph.D.

Doctoral thesis

Multiscale simulations of protein-protein interactions

Multiscale simulations of protein-protein interactions
Abstract:
Tato dizertační práce se zabývá studiem protein-membrána a protein-protein interakcí za použítí modelů s různou úrovní zhrubení pomocí metod molekulové dynamiky a Monte Carlo simulací. V práci je použita celá řada modelů od vysoce zhrubených modelů, kde je celý protein aproximován jednou částicí s povrchovou interakcí, až po atomární modely. Použítí modelů s různým rozlišením nám tak umožňilo studovat …more
Abstract:
In this dissertation thesis, we studied protein-membrane and protein-protein interactions in models with different levels of coarse-graining via methods of molecular dynamics and Monte Carlo simulations. We employed variety of models ranging from highly coarse-grained ones, where the whole protein is approximated by a single patchy particle, to atomistic models. The use of models with different resolution …more
 
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 9. 2020

Thesis defence

  • Date of defence: 13. 1. 2021
  • Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
  • Reader: prof. Dr. hab. Lukasz Cwiklik, Ph.D., RNDr. Mgr. Jan Heyda, Ph.D.

Citation record

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta