Analýza a charakteristika vybraných polymorfních mikrosatelitů z řádu trubkonosí a tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u pelikána afrického (Pelecanus rufescens).

Bc. Kristýna KOPEČNÁ

Diplomová práce

The analysis and characterization of selected polymorphic microsatellites from orders Procellariiformes and Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in Pink-backed Pelican (Pelecanus rufescens).

Anotace:

Moje diplomová práce se věnovala charakterizaci 36 mikrosatelitních lokusů u pelikána afrického. V teoretické části je rozebírána problematika vztahů mezi řády tučňáci, trubkonosí a veslonozí a také stručná charakteristika pelikána afrického. Dále je rozebírán vznik a variabilita mikrosatelitů, jejich hledání a analýza. Poslední část teorie se týká de novo a cross-species mikrosatelitů u pelikánů. V experimentální části byla použita metoda cross-species PCR amplifikace pro charakterizaci 36 párů primerů na 12 nepříbuzných jedincích pelikána afrického. Po amplifikaci byla provedena elektroforetická separace produktů a jejich genotypizace, následovala analýza v programech Cervus 3.0.7 a Genepop 4.7.5. Celkem bylo charakterizováno 33 nezávislých polymorfních lokusů se 2-5 alelami.

Abstract:

My master thesis was about characterization of 36 microsatellite loci of the Pink-backed Pelican. The problematics of relationships between penguins, Procellariiformes and Pelecaniformes and the short characteristics of Pink-backed Pelican are solved in the theoretical part. Then I wrote about the origin, variability, search and analysis of microsatellites. The last part is about de novo and cross-species microsatellites in pelicans. I have used the cross-species PCR amplification method for characterizing of 36 primer pairs at 12 unrelated individuals of Pink-backed Pelican. After the amplification, I have done electrophoretic separation of the products and then I was genotyping them. Then the results were analyzed in programs Cervus 3.0.7 and Genepop 4.7.5. Totally, I have characterized 33 independent polymorphic microsatellite loci with 2-5 alleles.

Klíčová slova

PCR amplifikace, mikrosatelit, pelikán africký, Pelecanus rufescens, Sphenisciformes, Procellariiformes, trubkonosí, tučňáci

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 5. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie