Evaluation Framework for Comparative Analysis of Protein Structure Embedding Methods in the AlphaFold Database – Bc. Lucie Novotná
Bc. Lucie Novotná
Master's thesis
Evaluation Framework for Comparative Analysis of Protein Structure Embedding Methods in the AlphaFold Database
Evaluation Framework for Comparative Analysis of Protein Structure Embedding Methods in the AlphaFold Database
Anotácia:
Revoluce v predikci struktury proteinů, kterou přinesl AlphaFold, otevřela nové možnosti ve výzkumu strukturální biologie. I když je databáze AlphaFold, zahrnující 214 milionů proteinových struktur, open source, její rozsáhlost představuje výzvu při hledání souvislostí mezi proteiny. Aby se usnadnila orientace v těchto rozsáhlých datech, bylo vytvořeno několik metod, které reprezentují proteiny pomocí …viacAbstract:
The revolution in protein structure prediction brought about by AlphaFold has opened new research possibilities in structural biology. Though the AlphaFold database, consisting of 214 million protein structures, is open source, its voluminous nature presents a significant challenge for extracting meaningful knowledge. While several protein vector representation methods have been created to ease orientation …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/h81ci/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 21. 6. 2024
- Vedúci: RNDr. Terézia Slanináková
- Oponent: doc. RNDr. Vlastislav Dohnal, Ph.D.
Citační záznam
Citace dle ISO 690:
NOVOTNÁ, Lucie. \textit{Evaluation Framework for Comparative Analysis of Protein Structure Embedding Methods in the AlphaFold Database}. Online. Diplomová práca. Brno: Masarykova univerzita, Faculty of Informatics. 2024. Dostupné z: https://theses.cz/id/wo26s2/.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / odbor:
Artificial intelligence and data processing / Big data