Původci střevních infekcí u dětí a jejich kultivace, diagnostika

Jana PETROVÁ

Bachelor's thesis

Etiological agents of enteric infections in children, their detection and identification in microbiological laboratory

Abstract:

Práce se týká střevních infekcí u dětí včetně kultivace a diagnostiky patogenů. Pozornost byla zaměřena na dětskou populaci ve věku do 15 let. Praktickou část jsem prováděla a data získala v laboratoři LABOMA, mikrobiologická laboratoř s.r.o. Biologickým materiálem byl výtěr z recta nemocného dítěte. V teoretické části práce jsem věnovala pozornost nejčastějším střevním agens. Z bakteriálních původců se jedná o zástupce z čeledi Enterobacteriaceae. Protože však tyto patogeny způsobují i jiná onemocnění než střevní, je práce zaměřená na druhy Salmonella enterica, Shigella sp., Escherichia coli a Yersinia enterocolitica. Mezi zmiňované virové patogeny patří rotaviry a adenoviry. Cílem této práce je zhodnocení pracovního postupu z důvodu co nejrychlejšího a nejpřesnějšího zjištění etiologického agens příslušného chorobného stavu, v tomto případě průjmového onemocnění. Dále pak statistické vyhodnocení dat z hlediska výskytu střevních patogenů (bakterií i virů) u dětí za loňský rok, tzn. 2008. Při identifikaci všech agens jsem použila dostupné diagnostické metody prováděné v rutinní mikrobiologické praxi. U bakteriálních původců to byla kultivace, isolace, serotypizace a konečná biochemická identifikace (biochemická řada), u virových pak určení antigenu ve stolici na základě komerčně vyráběných testů. V biologickém materiálu jsem prokázala většinu zmiňovaných bakterií a virů. Zjistila jsem, že pro odhalení záměny bakterie Salmonella enterica serotyp Enteritidis nestačí spoléhat pouze na isolaci a serotypizaci. Směrodatné a určující je stanovení fenotypických vlastností biochemickou řadou. Statisticky jsem vyhodnotila výskyt většiny agens u cílové populace. Z grafu je patrné, že u bakterie Salmonella enterica výrazně převažuje serotyp Enteritidis.Ze studie vyplývá zejména skutečnost, že pokud má být správně identifikován mikroorganismus, je nutné postupovat podle nejvhodnějších dostupných diagnostických metod, čímž se eliminuje riziko záměny zmiňovaných agens.

Abstract:

The thesis deals with intestinal infections in children including cultivation and diagnostics of pathogens. The attention was focused on children population in the age up to 15 years. The practical part was carried out and the data was gained in the laboratory of Laboma, microbiology laboratory Ltd. The biological material was the smear from the rectum of an infected child. In the theoretical part the attention was paid to the most frequent intestinal agens. From the bacterial agens these are the representatives from the tribe Enterobacteriaceae. Beside intestinal these patogens cause also some other diseases. That is why the thesis is focused on the species Salmonella enterica, Shigella sp., Escherichia coli a Yersinia enterocolitica. Rotaviruses and adenoviruses belong among the mentioned viral pathogens. The objective of the thesis was the evaluation of the operating sequence from the reason of the fastest and the most accurate findings of etiological agens of a particular sick condition- in this case it is a diarrhoeal disease. Further it is the statistical data evaluation from the point of occurrence of intestinal pathogens (bacteria and viruses) in children in the year of 2008. During the identification of all agens I used the available diagnostic methods carried out in routine microbiology practice. In bacterial invadors they were: cultivation, isolation, serotypization, and final bio chemical identification (bio chemical row). In viral invadors they were: the determination of antigen in the stool on the basis of commercially produced tests. In biological material I proved the most of mentioned bacteria and viruses. I found out that for the replacement detection of bacteria Salmonella enterica serotype Enteritidis it is not possible to rely only on isolation and serotypization. The determination of fenotypical characteristics using bio chemical row is authoritative and designating. I evaluated the occurrence of the most agens in target population statistically. From the graph it is evident that in bacteria Salmonella enterica serotype Enteritidis dramatically prevails. The result of the study is the fact that if the microorgaism is to be correctly identified it is necessary to proceed according to the most suitable available diagnostic methods, by which means the risk of agens replacement is eliminated.

Keywords

idnetifikace, Enterobacteriaceae, střevní infekce, Salmonella Enteritidis, salmonelosa

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 7. 5. 2009

Accessible from:: 7. 5. 2009

Identifier: 13297

Thesis defence

• Date of defence: 19. 6. 2009
• Supervisor: MUDr. Radim Kramář, CSc.

University of South Bohemia in České Budějovice

Faculty of Health and Social Studies

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician