Modelování sítnicového cévního systému s cílem jeho obrazové extrakce a standardizace cévní tortuozity

Alice Křesťanová

Diplomová práce

Modeling of the Retinal Vascular System for Image Extraction and Standardization of Vascular Tortuosity

Anotace:

Diplomová práce se komplexně zabývá analýzou a modelováním retinálního cévního systému. Hlavním námětem práce je design a realizace plně automatického segmentačního modelu, umožňující extrakci oblasti cévního systému v rámci binárního modelu, kde ostatní retinální struktury jsou potlačeny. Důležitou vlastností modelu je senzitivita a robustnost, aby bylo možno deklarovat efektivitu segmentace v prostředí, disponující horšími obrazovými parametry. Z tohoto důvodu je navržený model rovněž testován pro data, kde cévní systém je vizualizován pod špatným kontrastem. Součástí analýzy je komparativní testování navrženého modelu vůči vybraným segmentačním metodám na základě objektivních měřítek. Navržený segmentační model umožňuje extrakci příznaků, hodnotící globální míru zakřivení příslušného cévního systému. Tato procedura je klíčová pro klasifikaci patologické tortuozity, která je rovněž námětem této práce. Navržený model je vybaven registrační procedurou, umožňující kompenzovat geometrické diference při opakovaném snímání retiny. Navržený model byl testován a verifikován na datasetu ze systému RetCam 3, čítající 44 záznamů.

Abstract:

This diploma thesis deals with complex analysis and modeling of the retinal vascular system. The aim of the thesis is the design and implementation of a fully automated segmentation model, allowing extraction of the blood system area within the binary model, where other retinal structures are suppressed. An important feature of the model is sensitivity and robustness to declare the effiency of segmentation in a environment with worse image parameters. For this reason, the designed model is also tested for data where the vascular system is visualized under low contrast. Part of the analysis is the comparitive testing of the designed model against selected segmentation methods based on objective criteria. Designed segmentation model allows the extraction of symptoms that evaluate the global degree of curvature of the vascular system. This procedure is key for the classification of pathological tortuosity, which i salso the subject of this work. The designed model is equipped with a registration procedure that allows to compensate geometric differences during repeated retinal scanning. The designed model was tested and verified on dataset from system RetCam 3, containing 44 images.

Klíčová slova

Tortuozita, sítnice, detekce, cévní řečiště, retinopatie nedonošených, RetCam3, MATLAB

Keywords

Tortuosity, retina, detection, blood vessels, retinopathy of prematurity, RetCam3, MATLAB

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 31. 5. 2018
• Vedoucí: Marek Penhaker
• Oponent: Juraj Timkovič

VŠB - Technická univerzita Ostrava

Fakulta elektrotechniky a informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Elektrotechnika / Biomedicínské inženýrství