MikroRNA jako prognostické a prediktivní markery u metastatického renálního karcinomu

Bc. Júlia Kováčová

Master's thesis

MicroRNAs as prognostic and predictive markers of metastatic renal cell carcinoma

Abstract:

Metastatic renal cell carcinoma (mRCC) is highly chemo- and radioresistant tumor currently treated with using low molecular tyrosine kinase inhibitors of pathways activating tumor angiogenesis. Relapse is occurring after variably long disease-free period which is a differentiating criterion for responding and non-responding patients. At present, there is no reliable biomarker for precocious identification of patients with response to treatment. Plethora of studies shows that microRNA, small noncoding regulatory RNAs, have necessary properties of biomarker and deregulation of their physiological levels correlates with various pathological conditions, tumour transformation including, as well as with specific parameters of such conditions. In this diploma thesis, high-throughput microarray analyses were applied in a set of 60 patients to identify significantly deregulated miRNAs (miR-191*, miR-4655-5p, miR-1231, miR-933, miR-483-5p, miR-92b, miR-6880-5p, miR-5001-3p, miR-16-2-3p, miR-4728-5p) in the group without response to treatment in comparison to the group with good response and to validate these miRNAs on independent cohort of 91 patients using qRT-PCR. There was found no microRNA usable as biomarker with adequate statistical significance.

Abstract:

Metastatický renální karcinom (mRCC – metastatic renal cell carcinoma) je značně chemo- a radiorezistentní typ nádoru, který je léčený nízkomolekulárními inhibitory tyrozinkináz v drahách aktivujících nádorovou angiogenezi. Relaps onemocnění nastává po variabilně dlouhém bezpříznakovém období, na základě kterého je možné pacienty rozdělit na neodpovídající a odpovídající na léčbu. V současnosti neexistuje spolehlivý biomarker, pomocí kterého by bylo možné včas identifikovat pacienty, u kterých léčba bude účinná. Množství studií dokazuje, že mikroRNA, malé nekódující regulační RNA, mají potřebné vlastnosti biomarkeru a změna jejich fyziologických hladin koreluje s různými patologickými stavy, včetně nádorových změn tak jako i se specifickými parametry těchto stavů. V této diplomové práci byly pomocí vysokokapacitní čipové analýzy na souboru 60 pacientů identifikované miRNA (miR-191*, miR-4655-5p, miR-1231, miR-933, miR-483-5p, miR-92b, miR-6880-5p, miR-5001-3p, miR-16-2-3p, miR-4728-5p) významně deregulované u pacientů bez odpovědi oproti pacientům s odpovědí ne léčbu a tyto miRNA byli následně validované na nezávislé kohortě 91 pacientů pomocí qRT-PCR. Bohužel ani jedna z validovaných miRNA neprokázala statisticky významný vztah k léčebné odpovědi na inhibitory tyrozinkináz.

Keywords

mikroRNA, mRCC, sunitinib, pazopanib, biomarker

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2017

Thesis defence

• Date of defence: 7. 6. 2017
• Supervisor: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics