Využití mikrosatelitů v ochranářské genetice velkých šelem

Bc. Hana Větrovcová

Bakalářská práce

The use of microsatellite loci in conservation genetics of large carnivores

Anotace:

Mikrosatelity jsou tandemově opakující se motivy o délce 2-6 bp. Mikrosatelity se vyskytují ve všech organismech, proto jsou ideálními markery využívanými v populačně-genetických studiích. Své uplatnění našly také v ochranářské genetice, jakožto vhodné genetické markery používané při analýze neinvazivně získaných vzorků DNA. Ochrana populací velkých šelem vyžaduje dostatek informací o populaci, které jde jen obtížně získat díky jejich nízké početnosti a skrytému způsobu života. Analýzou DNA z neinvazivně získaných vzorků (trusu nebo chlupů) je možné získat potřebné údaje o početnosti populace, distribuci a příbuzenských vztazích mezi jedinci populace, o genetické variabilitě populace, toku genů, přítomnosti inbreedingu, nebo bottlenecku, které je možné využít pro stanovení správných ochranářských opatření. Cílem této bakalářské práce je literární rešerše zaměřená na ochranářskou genetiku středoevropských druhů velkých šelem - rysa ostrovida (Lynx lynx), vlka obecného (Canis lupus) a medvěda hnědého (Ursus arctos) a zoptimalizování setu mikrosatelitů metodou cross-amplifikace, použitelných pro genotypizaci vzorků rysa ostrovida. Zoptimalizovaný set 15 mikrosatelitových lokusů bude použitý k analýze populace rysa ostrovida v rámci projektu „Monitoring velkých šelem v EVL Beskydy“.

Abstract:

Microsatellite loci are tandemly repeated motives of 2-6 base pairs (bp). Microsatellite loci occur in all organisms and represent genetic markers frequently used in population-genetics studies. Also they are often used in conservation genetics studies as suitable genetic markers for analyzing noninvasive DNA samples. Conservation of populations of large carnivores requires data about population that are hardly obtainable due to their low density and secret lifestyle. The necessary information about population density, distribution, relationships among individuals in population, genetic variability of population, gene flow, inbreeding or bottleneck can be obtained using DNA analysis of noninvasively obtained samples (hairs, faeces) and they can be used for correct assessment of conservation measures. The aims of this bachelor thesis were to write a literature review about conservation genetics of large carnivores in Central Europe - European lynx (Lynx lynx), European wolf (Canis lupus) and European brown bear (Ursus arctos) and to optimize set of microsatellite loci suitable for genotyping of European lynx samples. This final set of 15 microsatellite loci will be used for population-genetics analysis of European lynx in the project "Monitoring of large carnivores in EVL Beskydy".

Klíčová slova

Mikrosatelity, ochranářská genetika, vlk obecný, medvěd hnědý, rys ostrovid, microsatellite loci, conservation genetics, European wolf, European lynx, European brown bear

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2011
• Vedoucí: Mgr. Jarmila Krojerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Systematická biologie a ekologie