Polymorfismus androgenového receptoru jako důsledek progrese nádoru prostaty

Eva GOTTWALDOVÁ

Bachelor's thesis

Polymorphism of the androgen receptor as a result of progression of the prostate cancer

Abstract:

Tato bakalářská práce je zaměřena na detekci jednonukleotidového polymorfismu androgenového receptoru pomocí PCR amplifikace a RFLP analýzy u pacientů s rakovinou prostaty. V teoretické části práce je popsána stavba a funkce prostaty, na kterou navazuje popis struktury a funkce androgenového receptoru. V dalších částech jsou charakterizovány rakovina prostaty z hlediska dostupné terapie, příčiny kastračně-rezistentního stádia rakoviny prostaty a možnosti jeho léčby. Polymorfismus androgenového receptoru obsahuje část věnující se oblastem s výskytem tandemově se opakujících trinukleotidových sekvencí, poly-glutaminovou (CAG)n a poly-glycinovou (GGC)n, a jednonukleotidovému polymorfismu. V závěru teoretické části práce jsou popsány mutace jednotlivých domén androgenového receptoru. V experimentální části bylo testováno 28 archivovaných vzorků biopsií od 11 pacientů s diagnostikovanou rakovinou prostaty, které byly fixovány formalínem a zality do parafínu (FFPE). Pomocí polymerázové řetězové reakce a analýzy RFLP bylo detekováno 11 tkáňových vzorků s polymorfní alelou A a 17 tkáňových vzorků s nepolymorfní alelou G. Detekovaný polymorfismus byl potvrzen přímým sekvenováním u šesti vybraných tkáňových vzorků.

Abstract:

This bachelor thesis is focused on detection of the single nucleotide polymorphism of androgen receptor based on PCR amplification and RFLP analysis in patients with prostate cancer. Theoretical part of this thesis describes the structure and function of the prostate, followed by characterization of the structure and function of the androgen receptor. In other parts, the prostate cancer is characterized from the point of view of the available treatment, causes of castration-resistant prostate cancer and its treatment options. Polymorphism of the androgen receptor includes parts with description of tandem repeating trinucleotide sequences, polyglutamine (CAG) and polyglycine (GGC), and single nucleotide polymorphism. At the end of the theoretical part, the mutation of androgen receptor domains are characterized. In the experimental part was tested 28 archived samples of biopsy from 11 patients with prostate cancer, formaline-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue. Polymerase chain reaction and RFLP analysis detected 11 tissue samples with polymorphic allele A and 17 tissue samples with non-polymorphic allele G. Detected polymorphism was confirm by direct sequencing in six selected tissue samples.

Keywords

Jednonukleotidový polymorfismus (SNP), androgenový receptor, rakovina prostaty

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 5. 2018

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Kateřina Smešný Trtková, CSc.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology