Pigmentace trichomů sóji luštinaté Glycine max [L.] Merr. jako důležitý agronomický znak

Adéla FRANKOVÁ

Bachelor's thesis

Pigmentation of trichomes in soybean Glycine max [L.] Merr. as an important agronomical trait

Anotácia:

Tato bakalářská práce se zabývá trichomy, jejich vlivem na albedo, biosyntetickou drahou flavonoidů, jejich regulací na úrovni transkripce a jejich účinky na lidské zdraví. V teoretické části jsem popsala publikované alely a geny zodpovědné za pigmentaci trichomů. Popsané mutace v těchto genech však nevysvětlují fenotyp u všech variet. Cílem praktické části je najít a ověřit kandidátní geny, které by dovysvětlily pigmentaci trichomů. K tomu jsem použila bioinformatické nástroje SNPViz v2.0, AccuTool, BLAST a Katalog alel sóji. Za použití zmíněných nástrojů jsem vyloučila původně navržený publikovaný gen Glyma.16g016500. Naopak jsem nalezla statisticky významnější mutace v genomických oblastech asociovaných s pigmentací, tyto geny jsem navrhla jako kandidátní.

Abstract:

This bachelor thesis deals with a study of trichomes of Glycine max, their effect to albedo, the biosynthesis of flavonoid, regulation of this biosynthesis at the transcriptional level and effect of flavonoids to human health. The theoretical part deals with published alleles and genes which are responsible for the pigmentation of trichomes. However, not all of the phenotypic variance is explained by published alleles and genes. The goal of the practical part is to find and verify candidates genes, which would explain the remaining phenotype. In this study there were used bioinformatical tools such as SNPViz v2.0, AccuTool, BLAST and Soybean Allele Catalogue. By using the mentioned tools, the proposed gene Glyma.16g016500 was excluded. I found statistically more significant mutations in the genomic regions associated with pigmentation, these genes were proposed as candidates.

Kľúčové slová

Sója, Glycine max, trichomy, flavonoidy, albedo, přirozená genetická variabilita

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Mária Škrabišová, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry