Vliv pH na stabilitu lektinů

Bc. Hana Berezňáková

Bakalářská práce

pH influence on lectin stabilities

Abstract:

Lectins are proteins of non-immune origin that have the ability to reversibly bind saccharides. They occur in all organisms and have different functions. Bachelor thesis aims to determine the effect of pH on the secondary and quaternary structure of lectins and effect on interactions between a lectin and a saccharide. Lectin AFL1 from fungi Aspergillus fumigatus, lectin BP39L from bacterium Burkholderia pseudomallei and lectin PA-IIL from bacteria Pseudomonas aeruginosa are under investigation. These lectins may naturally occur at pH which is different from that usually used when working with proteins. This change could affect the structure and properties of lectin. It is not well known, how the pH affects lectins, but any new finding could be important for further use of lectins in biotechnology or diagnostics. The effect of pH was studied by use of analytical ultracentrifugation, CD spectroscopy and surface plasmon resonance.

Abstract:

Lektiny jsou proteiny neimunitního původu, které mají schopnost reverzibilně vázat sacharidy. Vyskytují se ve všech organismech a mají různé funkce. Bakalářská práce je zaměřena na zjištění vlivu pH na sekundární a kvartérní strukturu lektinů a vliv na interakce mezi lektinem a sacharidem. Zkoumané jsou lektiny AFL1 z plísně Aspergillus fumigatus, BP39L z bakterie Burkholderia pseudomallei a lektin PA - IIL z bakterie Pseudomonas aeruginosa. Tyto lektiny se mohou v přírodě vyskytovat při jiném pH než se běžně používá při práci s proteiny v laboratoři. Případná změna by mohla mít vliv na strukturu nebo vlastnosti lektinu.Není velmi známé, jakým způsobem pH ovlivňuje lektiny, ale případné nové poznatky by mohly být důležité pro další využití lektinů v biotechnologiích nebo diagnostice. Vliv je zkoumán s využitím analytické ultracentrifugace, CD spektroskopie a rezonance povrchového plazmonu.

Klíčová slova

lektin, lectin, AFL1, BP39L, PA-IIL, vliv pH, infulence of pH, analytická ultracentrifugace, analytical ultracentrifugation, CD spektroskopie, CD spectroscopy, rezonance povrchového plazmónu, surface plasmon resonance

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2015
• Vedoucí: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie