Srovnání střevního a orálního mikrobiomu dětí narozených přirozeným porodem a císařským řezem

Bc. Kristýna Koželuhová

Diplomová práce

Comparison of the gut and oral microbiome of children born by natural birth and caesarean section

Anotace:

Střeva a dutina ústní člověka jsou osídleny tisíci druhy bakterií. Tyto bakterie jsou ve většině případů pro člověka prospěšné a plní základní funkce, kterými není lidské tělo vybaveno. Při dysbióze, jejíž vznik je ovlivněn mnoha faktory, ale dochází k přemnožení bakterií s patogenním potenciálem, což může vést k rozvoji řady onemocnění. Vědecké studie ukázaly, že je pro správný vývoj lidského mikrobiomu zásadní již způsob, jakým se člověka narodí. Diplomová práce se zabývá právě tímto důležitým tématem. Jako první fáze kohortové studie CELSPAC:TNG byly první dny po porodu odebrány vzorky střevního mikrobiomu novorozenců a orálního mikrobiomu novorozencům a jejich matek. Vzorky byly po izolaci DNA a amplifikaci genu pro 16S rRNA osekvenovány na přístroji MiSeq (Illumina). Následně byly pozorovány odlišnosti mezi střevním a orálním mikrobiomem novorozenců narozených přirozeným porodem či císařským řezem a to, zda orální mikrobiom matek přispívá k bakteriálnímu osídlení těchto míst lidského těla jejich dětí.

Abstract:

The human intestine and oral cavity are inhabited by thousands of bacterial species. In most cases, these bacteria are beneficial for the human host and perform basic functions that the human body is not equipped with. In dysbiosis, the onset of which is influenced by many factors, there is an overgrowth of bacteria with pathogenic potential and a number of diseases can develop. Scientific studies have shown that the mode of delivery is essential for the proper development of the human microbiome. The diploma thesis focuses on this important topic. In the first phase of the CELSPAC:TNG cohort study, samples of the intestinal microbiome of neonates and the oral microbiome of neonates and their mothers were taken the first days after delivery. Samples were sequenced on a MiSeq device (Illumina) after DNA isolation and 16S rRNA gene amplification. Subsequently, differences were observed between the intestinal microbiome and the oral microbiome of the neonates delivered vaginally or by cesarean section and whether the oral microbiome of mothers contributes to the bacterial colonization of these parts of the human body of their children.

Klíčová slova

střevní mikrobiom, orální mikrobiom, novorozenec, způsob porodu, vývoj, sekvenování nové generace, gut microbiome, oral microbiome, neonate, mode of delivery, development, next-generation sequencing

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 7. 2020
• Vedoucí: Mgr. Petra Vídeňská, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Speciální biologie