Střevní a bukální mikrobiom v prvním roce života dětí

Bc. Jacek Marciniak

Master's thesis

The gut and buccal microbiome during the first year of life

Abstract:

Lidský mikrobiom se významně podílí na metabolických, fyziologických a imunitních funk-cích hostitelského organismu. Správný vývoj mikrobiomu v novorozenecké a kojenecké fázi má dalekosáhlý dopad na zdraví v pozdějším životě. Střevo obsahuje nejpočetnější a dru-hově nejbohatší mikrobiom, jež je pro přežití člověka zcela nezbytný. Je také považován za klíčového hráče ve vývoji nejen trávícího traktu, ale také imunitního a zřejmě i nervového systému. Orální mikrobiom je co do velikosti a různorodosti druhý v pořadí a hraje význam-nou roli především ve zdraví ústní dutiny. Může se také podílet na onemocněních týkajících se celého organismu. Znalost složení a průběhu vývoje střevního a orálního mikrobiomu má význam pro diagnostiku, prevenci a objasnění etiologie řady onemocnění. Tato práce na základě výsledků sekvenace genu pro 16S rRNA podrobně popisuje vývoj fekálního a bukálního mikrobiomu 8 dětí v průběhu 1. roku života a uvádí ho do kontextu událostí v životě dětí, které jej mohou ovlivnit. Dále jsou na základě výsledků cílené proteo-mické analýzy imunitních markerů popsány změny jejich hladin ve sledovaném období. Tyto imunitní markery poskytují informace o vývoji dětského střeva a případných zánětlivých reakcích, které v něm probíhají.

Abstract:

Human microbiome participates in metabolic, physiological and immune functions of the host organism. Correct development of the microbiome in infancy has a far reaching effect on health and well being in later life. The gut contains the most abundant and diverse mi-crobiome, which is essential for human survival. It is also considered as a key player in the development of not only the gastrointestinal tract, but also the immune and possibly also nervous systems. Oral microbiome takes a second place when it comes to abundance and diversity. It has a pivotal role in oral health but also may participate in systemic diseases. The understanding of gut and oral microbiomes composition and development is crucial for diagnostics, prevention and etiological explanation of many diseases. This work describes in great detail gut and oral microbiome development in 8 children during the first year of their life based on the results of 16S rRNA gene sequencing. The re-sults are presented in context of life events which occurred during the examined period and which may influence the microbiome. Furthermore targeted proteomic analysis of selected immune markers was performed to depict their levels dynamics during the examined pe-riod. Immune markers provide information about gut maturity and potential inflammatory reactions.

Keywords

střevní mikrobiom, gut microbiome, orální mikrobiom, oral microbiome, 16S rRNA sekvenace, 16S rRNA sequencing, novorozenec, newborn, kojenec, infant, vývoj, development, imunitní markery, immune markers

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2022

Thesis defence

• Date of defence: 23. 6. 2022
• Supervisor: Mgr. Lenka Kosečková Micenková, Ph.D.
• Reader: Mgr. Kateřina Tomanová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Animal Biology and Immunology / Immunology