Detekce asymetrických tunelů v proteinech pomocí Voroného diagramu – Bc. Jakub Vallo
Bc. Jakub Vallo
Master's thesis
Detekce asymetrických tunelů v proteinech pomocí Voroného diagramu
Detection of asymmetric tunnels in proteins using Voronoi diagram
Abstract:
Proteíny sú obrovské makromolekuly, ktoré sa zúčastňujú na veľkom množstve katalytických reakcií v ľudskom tele. Funkcia proteínu je vo veľkej miere určená jeho štruktúrou a regiónom zvaným aktívne miesto. Tieto aktívne miesta sa obyčajne nachádzaju hlboko v molekule proteínu prístupné iba cez volné vstupy zvané tunely. V tejto práci preskúmame aktuálne dostupné algoritmy na detekciu tunelov v proteínoch …moreAbstract:
Proteins are large macromolecules involved in a vast array of catalytic reactions in our bodies. The function of a protein is mainly determined by its structure and a special region called an active site. These active sites are usually buried deep inside the protein molecule accessible only by void paths, i.e., tunnels. In this thesis we examine currently available algorithms for the detection of tunnels …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 1. 2017
Identifier:
https://is.muni.cz/th/kd15d/
Thesis defence
- Date of defence: 9. 2. 2017
- Supervisor: RNDr. Adam Jurčík, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
-
Geometry-based Methods for Detection of Asymmetric Tunnels in Proteins
Adam Jurčík -
Rozšíření nástroje CAVER Analyst o prozkoumávání proteinových tunelů ve virtuální realitě
Jiří Kletečka -
Pokročilý nástroj pre skriptovanie v aplikácii CAVER Analyst
Andrej Mrázik -
Vývoj webového rozhraní programu CAVER pro výpočet tunelů v proteinech
Jan Sládek