Mutační analýza genu CFTR

Iwona PLAVECKÁ

Bakalářská práce

Mutation Analysis of The CFTR Gene

Anotace:

V této práci jsem se věnovala provedení metody long-range PCR, která je výchozí metodou pro určení haplotypu mutace R117H a polymorfismu IVS-8 T(n) v genu CFTR u pacientů s některými mírnějšími formami cystické fibrózy. U tří pacientů jsem touto metodou amplifikovala exony 4-8 genu CFTR o délce 17,7 kb. Část amplifikovaného úseku genu CFTR jsem sekvenovala. Výsledky sekvenování potvrdily správnost produktu. Metodou nested PCR byly u těchto tří pacientů stanoveny polymorfismy T(n) v intronu 8. Na tyto analýzy mělo navázat použití metody ARMS PCR pro selektivní amplifikaci alely nesoucí mutaci R117H a stanovení typu polymorfismu T(n) sekvenací. Selektivní amplifikace metodou ARMS PCR však nebyla úspěšná.

Abstract:

In this bachelor's thesis I dealt with the execution of the method Long-Range PCR, which is the default method for determination of the haplotype of the mutation R117H and the polymorphism IVS-8 T(n) in the gene CFTR in patients with some moderate forms of pulmonary fibrosis. I amplified exons 4-8 of the gene CFTR with the length 17,7 kb in three patients using this method. I sequentialized a part of the amplified section. The results of the sequentialization confirmed the correctness of the product. In these three patients the polymorphisms T(n) were set in the intron 8. These analyses should have been followed in using the method ARMS PCR for a selective amplification of the allele carrying the mutation R117H and a determination of the type of polymorphism T(n) using sequentialization. However, the selective amplification using the method ARMS PCR wasn't successful.

Klíčová slova

Cystická fibróza, gen CFTR, Long-Range PCR, ARMS PCR, mutace R117H, IVS-8

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2012

Zveřejnit od: 30. 4. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 6. 2012
• Vedoucí: RNDr. Alfons Balcar

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA V OSTRAVĚ

Lékařská fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Specializace ve zdravotnictví / Zdravotní laborant