Analýza vlivu designu klinické studie a vstupních předpokladů na odhad velikosti vzorku

Bc. Pavla Kadlecová

Master's thesis

Analysis of the effect of study design on the sample size calculation

Abstract:

Stanovení správné velikosti vzorku pro klinickou studii je jedním z nejdůležitějších kroků při jejím plánování. Tato diplomová práce se zabývá vybranými aspekty problematiky stanovení velikosti vzorku a analýzy síly testu v projektech klinického hodnocení léčiv. Diplomová práce je členěna do celkem tří základních částí. V první, teoretické části je obsažen výklad základních pojmů z oblasti plánování velikosti vzorku a přehled hlavních faktorů ovlivňující velikost vzorku. V Teoretické části je také úvod do problematiky analýzy dat s chybějícími údaji a vysvětlení souvislostí se silou testu a odhadem velikosti vzorku. V praktické části jsou provedeny analýzy síly testu a odhady velikosti vzorku na reálných datech klinické studie a registru. Je provedena analýza vlivu volby spojitého, dichotomického nebo cenzorovaného primárního parametru na velikost vzorku, analýza vlivu charakteristik primárního parametru na odhad velikosti vzorku, dále analýza vlivu změny uspořádání (designu) klinického hodnoceni a analýza vlivu použité metody pro analýzu dat s chybějícími hodnotami na velikost vzorku. Součástí práce i je využití simulací při křížové validaci síly testu a při odhadu velikosti vzorku. Třetí část práce tvoří programy pro výpočty a simulace použité při analýze v praktické části práce.

Abstract:

Sample size determination is one of the most important steps in clinical trial planning. This diploma considered principal questions of sample size determination and power analysis in clinical trials. Diploma thesis is divided into three parts. First part is theoretical and is focused on introduction of main terms of sample size determination and clinical trial planning or designing. Part of this theoretical section introduces questions of data with missing values and methods used for data analysis whit missing values that affect of power. In practical part of diploma thesis is conducted power analysis and sample size calculation for real clinical trial or clinical register data. Power analysis of (1)choosing continuous, dichotomised or censored primary parameter, (1) influence of primary parameter characteristics, (3) influence of clinical trial design was performed and results are presented in this diploma thesis. Impact of method used for analysis of data whit missing values is explored in individual part. Not only basis calculation but also simulation and cross-validation are used for sample size estimation end power validation in diploma thesis. Next part of diploma thesis contents programs and macros used for sample size calculation and power analysis in practical part of thesis.

Keywords

klinické hodnocení, velikost vzorku, síla testu, předpoklady odhadu velikosti vzorku, primární cíl, uspořádání klinického hodnocení, clinical trials, sample size calculation, power analysis, presumptions for sample size calculation, primary endpoint, design of clinical trial

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 5. 2009

Thesis defence

• Date of defence: 18. 6. 2009
• Supervisor: Mgr. Adam Svobodník, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Mathematical Biology