Multiinstrumentální sledování interakce iontu těžkého kovu s volnými aminokyselinami

Bc. Ondřej Zítka

Diplomová práce

Multinstrumental investigation of heavy metal ions interaction with free aminoacids

Anotace:

Přínosem této práce je ukázka využití různých technik pro studium interakcí v oblasti metalomiky. Interakce volných aminokyselin s těžkými kovy je problematikou, která má jen částečnou vědeckou sledovanost. Přitom jak transport některých kovů, tak možnosti vazeb kovů na některé volné aminokyseliny, anebo menší biomolekuly jen dosud jen nedostatečně prozkoumán. Metody vyvinuté a použité v této práci by mohly být nápomocné právě při řešení takovéto problematiky, a to jako vhodné alternativy k mnohem nákladnějším technikám jako je NMR anebo RTG analýza. Tato práce mimo zaměření na aplikační možnosti UV-VIS spektrometrie a moderní průtokové elektrochemické detekce zasahuje i do oblasti studia proteomiky. Práce ukazuje patrnou komplementaritu oborů proteomika a metalomika. Znalosti sekvence konkretního proteinu totiž mohou být využity pro pokročilejší studia in vitro, které jsou právě specializací metalomiky. In-vitro studium fragmentů proteinu metalothioneinu může mimo jiné také poskytovat referenční údaje, které by mohly potvrzovat nebo vyvracet případné výpočetní analýzy tvorby komplexů.

Abstract:

The main contribution of this thesis is an example of the use of different techniques for the study of interactions in the field of metallomics. Interaction of free amino acids with heavy metals is an issue which has only partial scientific audience. However, both the transport of metals, and metal binding with free amino acids and/or small molecules have been poorly understood yet. Methods developed and used in this thesis can be very helpful in solving such issues and present an alternative to more costly techniques such as NMR or X-ray analysis. Beyond the scope of application possibilities of UV-Vis spectroscopy and advanced flow electrochemical detectors this thesis covers the field of proteomics. Thesis shows complementarity of proteomics and metallomics. The protein sequence of the particular protein can be used for advanced studies in vitro, which is the issue of metallomics. In vitro studies of metallothionein protein fragments can also provide a reference data that could confirm or refute any computational analysis of complex formation.

Klíčová slova

interakce, aminokyseliny, těžké kovy, peptidy, murexid, elektrochemická detekce

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2010
• Vedoucí: doc. Ing. René Kizek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie