Inhibice genové exprese prostřednictvím CRISPR interference

Hana JANČÍKOVÁ

Bakalářská práce

Inhibition of gene expression through CRISPR interference

Anotace:

Bakalářská práce shrnuje teoretické poznatky o podstatě CRISPR jakožto imunitního systému, dále jeho využití k cílené editaci genomu a CRISPR/dCas9 systému k regulaci genové exprese. Práce rovněž popisuje jiné techniky, kterými lze dosáhnout cílené editace genomu, nebo regulace transkripce. Dále se zabývá vlivem nukleosidového derivátu PNH192 na nádorové buněčné linie, u kterých došlo k inhibici genové exprese prostřednictvím CRISPR interference, přičemž byly identifikovány molekulární cíle nukleosidového derivátu PNH192, který má silné antineoplastické vlastnosti. V práci popisujeme provedený celogenomový screening za použití CRISPR interference, ověření exprese dCas9 proteinu a sgRNA u buněčné linie selektované nukleosidovým derivátem PNH192.

Abstract:

The bachelor thesis summarizes the theoretical knowledge about the fundamentals of CRISPR as an immune system, its use for targeted genome editing and the CRISPR/dCas9 system to regulate gene expression. The thesis also describes other techniques that can be used to achieve targeted genome editing or regulation of transcription. Furthermore, it discusses the effect of the nucleoside derivative PNH192 on cancer cell line in which gene expression has been inhibited through CRISPR interference, and the molecular targets of the nucleoside derivative PNH192, which has potent antineoplastic properties, have been identified. This thesis describes the whole-genome screening performed using CRISPR interference, validation of dCas9 protein and sgRNA expression in a cell line selected by the nucleoside derivative PNH192.

Klíčová slova

CRISPR interference, CRISPR/dCas9, identifikace molekulárních cílů, PNH192, regulace transkripce

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Agáta Kubíčková, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Experimentální biologie - specializace Experimentální biologie