Vazebný mód kvartérních izochinolinových alkaloidů na d(AAGAATTCTT)2

Bc. Martin Babinský, Ph.D.

Diplomová práce

Binding mode of quaternary isoquinoline alkaloids to d(AAGAATTCTT)2

Anotace:

V ľudskej populácii patria rôzne formy rakoviny k najčastejším príčinám úmrtí. Preto sa látky schopné inhibovať rast rakovinových buniek stali predmetom intenzívneho výskumu. Niekoľko členov rodiny protoberberínových alkaloidov preukázalo schopnosť viazať sa na DNA rakovinových buniek a spustiť ich apoptózu. Okolo spôsobu ich väzby na DNA však panuje mnoho nejasností. Cieľom tejto práce bola štruktúrna chakaterizácia komplexov syntetického DNA duplexu s alkaloidmi berberínom a palmatínom s využitím metód NMR spektroskopie a molekulového modelovania a následné určenie spôsobu ich väzby na DNA.

Abstract:

Various forms of cancer are among the leading causes of death in human population. Thus substances that can inhibit the growth of cancer cells are the subjects of intensive research. Several members of protoberberine family of alkaloids were shown to possess the ability to bind the DNA of cancer cell and trigger its apoptosis. Binding mode of these substances to DNA is not completely understood. The aim of this thesis was to utilize methods of NMR spectroscopy and molecular modelling in structural characterization of complexes between synthetic DNA duplex and alkaloids berberine and palmatine, and to determine the binding mode of these substances to DNA.

Keywords

berberín, berberine, palmatín, palmatine, mód väzby, binding mode, NMR, molekulové modelovanie, molecular modelling

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2009
• Vedoucí: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie