Sledování rychlosti hydrolýzy konjugačního činidla karbodiimidu ve vodných roztocích

Bc. Daniel Žatko

Bachelor's thesis

Monitoring hydrolysis of coupling reagent carbodiimide in aqueous solutions

Abstract:

This thesis deals with the behavior and stability of carbodiimide (EDC) in aqueous solutions. Theoretical part describes carbodiimides as one of the most used zero-length crosslinkers. For instance, carbodiimides are used for protein bioconjugation. Another part of the thesis descri-bes the mechanism of carbodiimide EDC cross-linking. Experimental part of the thesis develops a new simple method for monitoring car-bodiimide EDC hydrolysis. Observation of the period in which car-bodiimide is still active has a profit for further work with EDC, e.g. for the development of biosensors.

Abstract:

Táto bakalárska práca pojednáva o správaní sa 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) karbodiimid hydrochloridu (EDC) a jeho stabilite vo vodnom prostredí. Teoretická časť je venovaná práve karbodiimidom, ktoré sú jedny z najviac používaných “zero-length” konjugačných činidiel, využívaných napríklad pri konjugácii proteínov navzájom. Ďalej sa práca venuje popisu mechanizmu konjugačného činidla karbodiimidu EDC. Experimentálna časť práce sa zaoberá vývinom jednoduchej metódy, ktorá by dokázala sledovať hydrolýzu karbodiimidu vo vodnom prostredí. Zistenie doby, počas ktorej je karbodiimid ešte aktívny, má prínos pre ďalšie zaobchádzanie pri práci s EDC, napríklad pri príprave biosenzorov.

Kľúčové slová

Karbodiimid, 1-etyl-3-(3-dimetylaminopropyl) karbodiimid hydrochlorid, O-acylisourea, Biokonjugácia, Biokonjugácia proteínov, EDC mechanizmus, Proteíny, Carbodiimide, 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride, Bioconjugation, Protein bioconjugation, EDC mechanism, Proteins

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 6. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 6. 2022
• Vedúci: Mgr. Karel Lacina, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Jakub Sopoušek

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Chemistry / Biophysical Chemistry