Beta-hemolytické streptokoky v klinickém materiálu - jejich izolace a identifikace

Hana KAŇKOVÁ

Bachelor's thesis

Beta hemolytic streptococci in clinical material - their isolation and identification

Abstract:

Tématem mé bakalářské práce jsou: "Beta-hemolytické streptokoky jejich izolace a identifikace". V návaznosti na toto téma jsem si stanovila i cíl pro zpracování, kterým je rozlišení Streptococcus pyogenes od ostatních beta-hemolytických streptokoků. Při třídění těchto bakterií jsem se omezila na množství, které pocházelo z kultivací krčních výtěrů. Jako úvod do problematiky beta-hemolytických streptokoků, jsem zvolila stručné popsání bakteriální buňky struktury a funkce jednotlivých organel. Pokračovala jsem částí zabývající se streptokoky obecně, v níž určuji jejich zařazení mezi bakterie, popisuji obecnou strukturu a jmenuji nejdůležitější kritéria pro jejich základní rozdělení, to zahrnuje i přesnější vymezení streptokoků beta-hemolytických. V následující části zmiňuji jejich zástupce, u kterých uvádím základní charakteristiku a zaměřuji se na vlastnosti, díky nimž jsou schopni u člověka vyvolat onemocnění. Konkrétní choroby řeším v souvislosti s bakterií Streptococcus pyogenes, jež je jejich nejčastější příčinou a krátce se zmiňuji i o jejich léčbě Metodickou část jsem pojala jako celkový proces zahrnující preanalytickou, analytickou a postanalytickou fázi. V preanalytické části jsme se zabývala požadavkovým listem, odběrovým materiálem, transportem do laboratoře a rozdělením vzorků v laboratoři. Analytická část obsahuje všechny části zpracování konkrétního klinického materiálu (výtěr z krku). Zde se zmiňuji o kultivačních půdách, způsobu očkování a metodách určených k rozpoznání typu beta-hemolytických streptokoků. K tomu se využívá latexová aglutinace, případně automatický analyzátor MALDI Biotyper, který pracuje na principu hmotnostní spektrometrie. V závěru tohoto procesu, tedy v postanalytické fázi, jsem krátce popsala předání výsledků žadateli o vyšetření. V kapitole obsahující výsledky mé práce, jsem zpracovala data o množství jednotlivých beta-hemolytických streptokoků za rok 2013, diagnostikovaných z krčního výtěru, které byly určeny laboratoří Synlab České Budějovice, pomocí metod uvedených v metodické části (PYR-test a latexová aglutinace). Všechna data, získaná z laboratorního systému LIS, jsem vložila do souhrnné tabulky, s kterou jsem pracovala při vytváření dalších schémat, důležitých pro zodpovězení formulovaných hypotéz. Pro získání odpovědi na první hypotézu, v níž předpokládám, že výskyt beta-hemolytických streptokoků je po celý rok stejný, jsem vytvořila souhrnný sloupcový graf obsahující data za všechna zkoumaná období a spojnicový graf, pro jehož vznik jsem zhotovila tabulku, kde jsou zaznamenaná množství všech beta-hemolytických streptokoků, v závislosti na ročním období. Pomocí těchto schémat jsem hypotézu vyvrátila. Pro zodpovězení druhé hypotézy, ve které jsem zjišťovala, zda Streptococcus pyogenes početně převažuje nad ostatními diagnostikovanými typy beta-hemolytických streptokoků, jsem vytvořila jednoduchý výsečový graf, vycházející z tabulky, v níž jsou zapsané celkové počty jednotlivých beta-hemolytických streptokoků za zkoumaný rok. Díky tomuto názornému schématu jsem byla schopná hypotézu potvrdit, jelikož výseč ukazující Streptococcus pyogenes zabírá přes 80 % celkového množství beta-hemolytických streptokoků. K určitému potvrzení mých závěrů jsem došla při srovnání zkoumaného roku 2013 s rokem 2012, čemuž se blíže věnuji v kapitole diskuse. V závěru práce bylo mým úmyslem zdůraznit důležitost výzkumu beta-hemolytických streptokoků, v souvislosti s jejich počtem a diagnostikovaným typem. To by mohlo být prospěšné v prevenci sekundárních komplikací, které mohou tyto streptokoky způsobit v případě neadekvátní léčby.

Abstract:

The topic of my bachelor's thesis is: "Beta-hemolytic streptococci their isolation and identification". In connection to this topic I set also the goal of the processing which is distinguishing of Streptococcus pyogenes from the other beta-hemolytic streptococci. During sorting these bacteria, I restricted the amount to those coming from cultivation of throat swabs. As introduction to the issue of beta-hemolytic streptococci I selected a short description of bacterial cell structure and function of individual organelles. I continued with the part dealing with streptococci in general, in which their classification as bacteria is determined, the general structure described as well as the most important criteria for their basic division, including also a more specific definition of beta-hemolytic streptococci . In the following part their representatives with their basic characteristic are mentioned. I focus on their attributes by which they are able to cause a disease of men. Particular diseases are analysed in connection with the bacterium Streptococcus pyogenes, which is the most frequency cause of diseases; also their treatment is mentioned shortly. I outlined the methodical part as a total comprehensive process including the pre-analytic, analytic and post-analytic stage. In the pre-analytic part I dealt with the request sheet, sampling material, transport into the laboratory and split of samples in the laboratory. The analytical part contains all the parts of processing of a particular clinical material (throat swab). In this part, the culture medium for cultivation, way of inoculation as well as methods determined for recognizing the type of beta-hemolytic streptococci are mentioned. The latex agglutination is used for this, possibly also the automatic analyser MALDI Biotyper, working at the principle of mass spectrometry. At the end of this process i.e. in the post-analytical stage I described shortly handing over the results to the applicant for examination. In the chapter containing the results of my work I processed the data on quantity of individual beta-hemolytical streptococci for the year 2013 diagnosed from the throat swab, determined by the laboratory Synlab České Budějovice by means of methods stated in the methodical part (PYR-test and latex agglutination). All the data acquired from LIS laboratory system were entered by me in a summarising table; I continued to work with this table during the creation of other schemes important for answering the formulated hypotheses. To acquire the answer to the first hypothesis in which I supposed that the occurrence of beta-hemolytic streptococci is the same all the year round, I created a summarising bar graph containing the data for all the examined periods and the line graph for the creation of which I prepared a table where the amounts of all the beta-hemolytic streptococci are recorded depending on season. By means of these schemes I refuted the hypothesis. In the second hypothesis I tried to find out if Streptococcus pyogenes prevails in quantity over the other diagnosed types of beta-hemolytic streptococci; I created a simple sector diagram based on the table in which the total numbers of individual beta-hemolytic streptococci for the given year are entered. Thanks to this illustrative scheme I was able to confirm the hypothesis as the section showing Streptococcus pyogenes covers more than 80 % of the total number of beta-hemolytic streptococci. I achieved a certain confirmation of my conclusions by comparing the examined year 2013 with the year 2012, I devote closer attention to this comparison in the chapter "discussion". My aim in the conclusion of the thesis was to accentuate the importance of the research of beta-hemolytic streptococci because of their quantity and diagnosed types. This could be beneficial for the prevention of secondary complication these streptococci may cause in case of a non-adequate medical treatment.

Keywords

Streptokoky, beta-hemolytické streptokoky, Streptococcus pyogenes, latexová aglutinace, PYR-test, MALDI Biotyper

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 5. 5. 2014

Accessible from:: 5. 5. 2014

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Radim Kramář, CSc.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Studies

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician