Analýza syntetické letality lidských enzymů modifikujících RNA

Bc. Emílie Kratochvílová

Bachelor's thesis

Analysis of the synthetic lethality of human RNA modifying enzymes

Abstract:

Epitranskriptomika je velmi rychle vyvíjející se obor. Zaměřuje se na modifikace bází RNA, které sice byly známy již desítky let, avšak hlubší pochopení jejich funkcí přinesly až nedávno objevené výzkumné metody. Nejvíce zastoupenou modifikací na mRNA je reverzibilní N6-methyladenosin (m6A). Methylová skupina je přidávána na adenosin pomocí skupiny proteinů nazývaných „writers“, odstraňována díky „erasers“ a dále m6A je rozpoznáváno enzymy zvanými „readers“, které v buňce plní celou řadu fyziologických funkcí. Přítomnost m6A na RNA tedy může výrazně ovlivnit regulaci genové exprese.

Abstract:

Epitranscriptomics is a rapidly developing field of study. It studies base modifications presented on the RNA, which have been known for decades. However, deeper understanding of their functions was only possi-ble after developing new research methods. The most abundant modifi-cation of the mRNA is a reversible N6 methyladenosine (m6A). A methyl group is added to adenosine via group of proteins called „writers“, re-moved by „erasers“ and recognized by enzymes termed „readers“, that have multiple physiological functions in a cell. Therefore, a gene ex-pression can be significantly influenced by the presence of the m6A on the RNA.

Keywords

epitranskriptomika, m6A, writers, readers, erasers

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 6. 2020

Thesis defence

• Date of defence: 16. 7. 2020
• Supervisor: doc. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
• Reader: Mgr. Stanislav Stejskal, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry