Účinky vybraných peptidů na jednobuněčnou řasu Chlamydomonas reinhardtii

Bc. Olga Avdeeva

Master's thesis

Effects of selected peptides on the unicellular alga Chlamzdomonas reinhardtii

Abstract:

V předložené práci byla prováděna aplikace modifikovaných novicidinových peptidů NVCAA a NVCHH na jednobuněčnou řasu Chlamydomonas reinhardtii. Cílem studie bylo zjistit minimální inhibiční koncentrace testovaných peptidů na bakterie Escherichia coli s následnou aplikací na jednobuněčnou řasu Chlamydomonas reinhardtii. Posouzení vlivu testovaných peptidu na řasu bylo prováděno pomocí spektrofotometrických analýz: obsahu chlorofylu A a chlorofylu B, celkového obsahu flavonoidů, celkové antioxidační kapacity a pomocí metody DPPH ASSAY. Molekulární změny Chlamydomonas reinhardtii byly stanoveny sledováním množství izolované RNA a exprese genů APX1, APX2, CAT1, CAT2 pomocí metody Real-time PCR. Statisticky zpracovaná data ukázala, že aplikace peptidů NVCAA a NVCHH vyvolaly značný stres řasy a tím zvýšila exprese genů zodpovědných za snížení oxidačního stresu.

Abstract:

In the presented work, the modified novicidin peptides NVCAA and NVCHH were applied to the unicellular alga Chlamydomonas reinhardtii. The aim of the study was to determine the minimum inhibitory concentrations of the tested peptides on Escherichia coli bacteria with subsequent application on the unicellular algae Chlamydomonas reinhardtii. The assessment of the effect of the tested peptides on the algae was carried out using spectrophotometric analyses: chlorophyll A and chlorophyll B content, total flavonoid content, total antioxidant capacity and using the DPPH ASSAY method. Chlamydomonas reinhardtii molecular changes were determined by monitoring the amount of isolated RNA and the expression of APX1, APX2, CAT1, CAT2 genes using the Real-time PCR method. Statistically processed data showed that the application of NVCAA and NVCHH peptides induced considerable stress in the cilia.

Keywords

novicidin, NVCAA, NVCHH, syntéza peptidů na pevné fáze, test minimální inhibiční koncentrace, kultivace řas, chlorofyl, flavonoidy, DPPH ASSAY, izolace RNA, syntéza cDNA, celková antioxidační kapacita, gelová elektroforéza, Real-time PCR, exprese genů

Keywords

NVCAA, NVCHH, solid-phase peptide synthesis, minimum inhibitory concentration test, algae cultivation, chlorophyll, novicidin, flavonoids, total antioxidant capacity, DPPH ASSAY, RNA isolation, cDNA synthesis, gel electrophoresis, Real-time PCR, gene expression

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 4. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 29. 5. 2023
• Supervisor: Ing. Vedran Milosavljević, Ph.D.
• Reader: Pavel Kopel, Ph.D.

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / specializace:
Molecular Biology and Biotechnology / Plant Molecular Biology and Biotechnology