Získávání znalostí v oblasti protinádorové chemoterapie z dat plátců zdravotní péče.

Bc. Alena Zoľáková

Master's thesis

The knowledge acquiring from health insurance claims data in field of anti-tumour chemotherapy

Abstract:

The knowledge acquiring from health insurance claims data in field of anti-tumour chemotherapy represents main goal of this thesis. Brief literature retrieval about practical application of the data from payers of health insurance is a component part. Oncological data recorded for health insurance companies represents one of sources, based on which it is possible retrospectively to analyze and evaluate the method and quality of chemotherapeutic treatment. A description and analysis of updated content of Electronic Library of chemotherapeutic regimes of DIOS project are also contained in the paper. Further, it contains pre-processing procedure of data recorded for health insurance companies and description of operation of algorithm for retroactive identification of applied regimens, supplemented by a tool for evaluation of compliance with dose intensity. Another part of the thesis is implementation and testing of proposed algorithm on data of Masarykuv onkologycky ustav Brno. After automated pre-processing and analysis, the data are compared based on ATC code, date of dispensing and dose size of applied cytostatic agents, to standard chemotherapeutic regimens in Electronic Library. The algorithm is designed in PL/SQL language (Procedural Language/Structured Query Language) and the obtained data are processed by database software Oracle. The elaborated algorithm enables diversification of practically applied regimens based on a type of given cytostatic agents, on a length of the treatment cycle of given substances, and on a range of given doses. Applied procedure distinguishes and entitles applied chemotherapeutic regimens and compared them to standard regimens from Electronic Library of chemotherapeutic regimens (approximately 74% recognised applied regimens). Component of the procedure is also a tool for evaluation of compliance with dose intensity in clinical praxis (the most precisely dosed chemotherapeutic regimens during adjuvant treatment of a breast cancer diagnosis – C50). After final processing of actual data, the paper provides summary of medical diagnosis, applied regimens and their compliance rate. It detects errors and refers to discrepancies during treatment application. In case of retroactively identified regimens, it states probability of identification or not identification of certain regimen based on descriptive statistical characteristics, as well as sensitivity of algorithm (almost 80%). Thesis exerts effort to contribute to improvement of Electronic Library of chemotherapeutic regimens and refers to possibilities of evaluation of anti-tumour chemotherapy by “data mining” from databases recorded for health insurance companies.

Abstract:

Diplomová práca sa zameriava na získavanie znalostí v oblasti protinádorovej chemoterapie z dát platiteľov zdravotnej starostlivosti. Súčasťou je stručná rešerš odbornej literatúry o využití dát platiteľov zdravotnej starostlivosti. Onkologické dáta vykazované pre zdravotné poisťovne sú jedným zo zdrojov, na základe ktorých je možné spätne analyzovať a vyhodnocovať spôsob a kvalitu chemoterapeutickej liečby. Práca obsahuje zakomponovaný popis a analýzu aktualizovaného obsahu digitálnej knižnice chemoterapeutických režimov projektu DIOS. Ďalej zahŕňa postup predspracovania dát vykazovaných pre zdravotné poisťovne a popis fungovania algoritmu na spätnú identifikáciu aplikovaných režimov, doplnený o nástroj na vyhodnotenie dodržania intenzity dávky. Súčasťou diplomovej práce je implementácia a testovanie navrhnutého algoritmu na dáta Masarykovho onkologického ústavu Brno. Po automatizovanom predspracovaní a analýze sú dáta porovnávané na základe ATC kódu, dátumu podania a veľkosti dávky aplikovaných cytostatík so štandardnými chemoterapeutickými režimami digitálnej knižnice. Algoritmus je navrhnutý v jazyku PL/SQL a získané dáta sú spracovávané pomocou databázového softvéru Oracle. Vypracovaný algoritmus umožňuje rozdelenie prakticky aplikovaných režimov na základe typu a počtu podaných cytostatík, dĺžky cyklu podania látok a rozsahu podaných dávok. Aplikovaná procedúra rozpoznáva a pomenúva aplikované chemoterapeutické režimy a porovnáva ich so štandardnými režimami z digitálnej knižnice chemoterapeutických režimov (približne 74% rozpoznaných aplikovaných režimov). Komponentom procedúry je aj nástroj na vyhodnocovanie dodržania intenzity dávky v klinickej praxi (najpresnejšie dávkované chemoterapeutické režimy pri adjuvantnej liečbe diagnózy karcinómu prsníka – C50). Po výslednom spracovaní reálnych dát práca poskytuje prehľad o liečených diagnózach, aplikovaných režimoch a miere ich dodržania. Odhaľuje chyby a poukazuje na nepresnosti pri aplikácii liečby. Pri spätne identifikovaných režimoch uvádza mieru pravdepodobnosti určenia, alebo neurčenia daného režimu na základe deskriptívnych štatistických charakteristík, ako aj senzitivitu navrhnutého algoritmu (takmer 80%). Práca sa snaží prispieť k zdokonaľovaniu digitálnej knižnice chemoterapeutických režimov a poukázať na možnosti vyhodnocovania protinádorovej chemoterapie pomocou „dolovania“ dát z databáz vykazovaných pre zdravotné poisťovne.

Keywords

Chemoterapeutický režim, Intenzita dávky, Digitálna knižnica DIOS, Algoritmus, Dáta zdravotnej poisťovne, Jazyk PL/SQL, Chemotherapeutic regimen, Dose intensity, Digital library DIOS, Algorithm, Data of health insurance company, PL/SQL language

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2011

Thesis defence

• Date of defence: 13. 6. 2011
• Supervisor: RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Mathematical Biology