Podíl falešné pozitivity ve studiích alternativního sestřihu v závislosti na volbě mapovacího algoritmu pro RNAseq dat – Bc. Anna Bílková
Bc. Anna Bílková
Master's thesis
Podíl falešné pozitivity ve studiích alternativního sestřihu v závislosti na volbě mapovacího algoritmu pro RNAseq dat
False discovery rate in alternative splicing studies as a function of RNAseq alignment algorithm
Abstract:
Sekvenování nové generace je v dnešní době pravděpodobně nejpoužívanější technika pro identifikaci primární struktury nukleových kyselin. Pro odhalení všech transkriptů v buňce v daném okamžiku se využívá RNA sekvenování. Stěžejním krokem analýzy dat pocházejících ze sekvenování nové generace je přiřazení krátkého čtení k referenčnímu genomu či transkriptomu. Během několika posledních let bylo vyvinuto …moreAbstract:
Nowadays, next-generation sequencing is probably the most important technique for rapid and accurate discovery of the primary structure of nucleic acids. RNA sequencing is used to reveal the presence of all transcripts in the cell in a particular moment. The fundamental task of next generation sequencing data analysis is the alignment of reads to an annotated reference genome or transcriptome. Many …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2016
Identifier:
https://is.muni.cz/th/cz59n/
Thesis defence
- Date of defence: 22. 6. 2016
- Supervisor: Mgr. Eva Budinská, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
BÍLKOVÁ, Anna. \textit{Podíl falešné pozitivity ve studiích alternativního sestřihu v závislosti na volbě mapovacího algoritmu pro RNAseq dat}. Online. Master's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2016. Available from: https://theses.cz/id/z24dzw/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Experimental Biology / Mathematical Biology
Theses on a related topic
-
Identifikace a analýza alternativního sestřihu v transkriptomu ječmene
Gabriela MAJZLÍKOVÁ -
Estimating the copy-number of chromosomes using next-generation sequencing data
Peter Guman -
Software for the detection of strand bias from the next-generation sequencing data
Alexandra Skysľaková -
Bioinformatics methods to connect the methylation data from profiling microarrays and next-generation sequencing
Siarhei Paliavoi -
Analýza panelu genů modifikujících průběh onemocnění cystické fibrózy pomocí technologie Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS)
Jan Tuček -
Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS) v molekulární diagnostice arytmogenních onemocnění
Iva Synková -
Metoda Next Generation Sequencing (NGS) a její využití v laboratoři klinické genetiky
Tereza Žáková -
Nová generace sekvenování (Next Generation Sequencing), využití v klinické diagnostice
Michaela Jaborníková