Zpět na vyhledávání

Laura-Nadine KROLL

Bachelor's thesis

Testing of different quality filtering algorithms on contig quality in plant transcriptome

Testing of different quality filtering algorithms on contig quality in plant transcriptome
Abstract:
RNA sequences of the carnivorous plant Utricularia vulgaris were used to test the impor- tance of RNA sequence quality control tools and the influence of those tools on a sequence assembly. Three quality control tools were examined, followed up by the testing of two dif- ferent assemblers. The results were then compared and evaluated.
Abstract:
RNA sequences of the carnivorous plant Utricularia vulgaris were used to test the impor- tance of RNA sequence quality control tools and the influence of those tools on a sequence assembly. Three quality control tools were examined, followed up by the testing of two dif- ferent assemblers. The results were then compared and evaluated.
 

Keywords

quality control RNA-sequences transcriptome assembly Utricularia vulgaris assembly algorithms
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 22. 5. 2020

Thesis defence

  • Supervisor: Ing. Jiří Bárta, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

KROLL, Laura-Nadine. Testing of different quality filtering algorithms on contig quality in plant transcriptome. Č. Budějovice, 2020. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=60745 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
  • No theses on a related topic available.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses z4y49s z4y49s/2
22/5/2020
Folders
Files
thesis KrollLaura_BachelorThesis.pdf
Bulánová, L.
23/5/2020

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.