Molekulárně biologická charakteristika exfoliatin A konvertujících fágů Staphylococcus aureus

Bc. Pavla Černíková, PhD.

Diplomová práce

Anotace:

Cílem mé diplomové práce bylo provést molekulární charakterizaci exfoliatin A-konvertujících fágů serologických skupin A a B (čeleď Siphoviridae), které byly izolované indukcí UV zářením z genomů virulentních kmenů Staphylococcus aureus. U studovaných bakteriofágů jsem provedla analýzu restrikčních spekter jejich genomů a srovnávací analýzu vybraných oblastí DNA, které obsahují gen eta, gen int, gen ami a dvě specifické sekvence, jedna z replikačního modulu a druhá z kapsidového modulu. Na základě výše uvedených analýz jsem stanovila příbuznost studovaných fágů navzájem a B-fágy jsem srovnávala s bakteriofágem ETA (Yamaguchi et al. 2000), jehož kompletní sekvence je uvedena v databázi GenBank.

Abstract:

We have studied four ETA-converting phages, three belonging to serogroup B and one of serogroup A. All phages were isolated from clinical ET-positive strains of S. aureus acquired from Czek and Slovak hospitals. In the center of our interest were especially B-phages 531, 534 and 557 included in this set. The genomes of these phages were compared by molecular tools with the genome of phage 435 of serogroup A isolated in a Czech hospital and Japanese phage ETA (serogroup B). The complete genome sequence of the latter one was obtained from GenBank database (Accession No NC_003288).

Klíčová slova

Mírné bakteriofágy druhu Staphylococcus aureus, bakteriofág ETA, exfoliativní toxin A, lyzogenní konverze.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 5. 2006

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2006
• Vedoucí: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika