Vliv exprese proteinů CPB1 a PDLIM2 na prometastatické vlastnosti nádorových buněk

Bc. Petra Martinková

Bachelor's thesis

The role of CPB1 and PDLIM2 protein expression on prometastatic properties of tumor cells

Anotácia:

Tato bakalářská práce se zabývá vlivem exprese proteinů karboxypeptidázay B1 (CPB1) a „PDZ and LIM domain protein 2“ (PDLIM2) na prometastatické vlastnosti nádorové buněčné linie MCF-7. V teoretické části jsou popsány vlastnosti těchto proteinů a také jejich úloha v nádorové biologii. Dále je v teoretické části popsána buněčná linie MCF-7 a „patient derived xenografts“ (PDX). V experimentální části práce byl pomocí mikroskopie atomových sil (AFM) zkoumán vliv overexprese CPB1 na viskoelastické vlastnosti buněčné linie MCF-7 a bylo zjištěno, že CPB1 snižuje tuhost těchto buněk. Součástí experimentální části práce bylo také studium protein-proteinových interakcí CPB1 a PDLIM2 in silico pomocí databáze STRING. U PDLIM2 byla provedena analýza interakcí protein-protein také in vitro pomocí pull-down assay a kombinace kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie (LC-MS/MS), přičemž byla identifikována řada potenciálních interakčních partnerů zapojených do cytoskeletu.

Abstract:

In this thesis, we focused on impact of carboxypeptidase B1 (CPB1) and PDZ and LIM domain protein 2 (PDLIM2) expression on prometastatic properties of cell line MCF-7. In the theory part these proteins are described and their role in the tumour biology. Next, cell lines MCF-7 and patients derived xenografts (PDX) were described in the theoretical part. In the experimental part of the thesis was examined an impact of CPB1 overexpression on viscoelastic properties of cell line MCF-7 using atomic force microscopy (AFM) and it was find out that CPB1 decreases rigidity of the cells. Part of the experimental part was a protein-protein interaction study of CPB1 and PDLIM2 in silico using STRING database. For PDLIM2 was performed an interaction analysis of protein-protein interaction in vitro using pull-down assay and combination of liquid chromatography and mass spectrometry (LC-MS/MS) leading to identification of set potential interaction partners involved in cytoskeleton formation.

Kľúčové slová

CPB1, PDLIM2, karcinom prsu, AFM, MCF7, protein-proteinové interakce, breast cancer, protein-protein interaction

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2017
• Vedúci: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry