Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky – Filip SAMOHÝL
Filip SAMOHÝL
Bachelor's thesis
Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky
Study of the 3D structure of RNA pospiviroid using molecular dynamics simulations
Abstract:
Cílem mé bakalářské práce bylo prozkoumat konformační chování RNA tetraloopu UUUC v roztoku pomocí molekulové dynamiky. Výsledky molekulově dynamických simulací budou porovnány s konformací mRNA v komplexu s histonovým proteinem získaném rentgenovou krystalografií a s dříve publikovanými NMR experimenty provedenými za různých podmínek v roztoku.Abstract:
The aim of my bachelor thesis was to investigate the conformational behavior of the RNA tetraloop UUUC in solution using molecular dynamics. The results of molecular dynamics simulations will be compared with the conformation of mRNA in complex with histone protein obtained by X-ray crystallography and with previously published NMR experiments performed under different conditions in solution.
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 5. 5. 2023
Thesis defence
- Supervisor: doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Citation record
The right form of listing the thesis as a source quoted
SAMOHÝL, Filip. Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky. Olomouc, 2023. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaPalacký University Olomouc
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Chemistry / Chemistry
Theses on a related topic
-
Parametrizace silového pole pro molekulárně dynamické simulace analogů nukleotidů nukleových kyselin
Michal Růžička -
Nízkoúrovňová optimalizace algoritmů komprese a dekomprese silového pole
Tomáš Raček -
Molekulární simulace proteinů
Matyáš SUCHÝ -
Vliv silného elektrického pole na strukturu polymerů ve vodných roztocích
Šárka DĚDIČOVÁ -
Analýza chování silových polí při simulacích DNA aRNA
Ivana Velikovská -
Viry a jejich role v evoluci organismů
Kristína Rovňáková
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights