Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky – Filip SAMOHÝL
Filip SAMOHÝL
Bakalářská práce
Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky
Study of the 3D structure of RNA pospiviroid using molecular dynamics simulations
Anotace:
Cílem mé bakalářské práce bylo prozkoumat konformační chování RNA tetraloopu UUUC v roztoku pomocí molekulové dynamiky. Výsledky molekulově dynamických simulací budou porovnány s konformací mRNA v komplexu s histonovým proteinem získaném rentgenovou krystalografií a s dříve publikovanými NMR experimenty provedenými za různých podmínek v roztoku.Abstract:
The aim of my bachelor thesis was to investigate the conformational behavior of the RNA tetraloop UUUC in solution using molecular dynamics. The results of molecular dynamics simulations will be compared with the conformation of mRNA in complex with histone protein obtained by X-ray crystallography and with previously published NMR experiments performed under different conditions in solution.
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 5. 2023
Obhajoba závěrečné práce
- Vedoucí: doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Citační záznam
Jak správně citovat práci
SAMOHÝL, Filip. Studium 3D struktury RNA Pospiviroidu metodami molekulové dynamiky. Olomouc, 2023. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaUNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Chemie / Chemie
Práce na příbuzné téma
-
Parametrizace silového pole pro molekulárně dynamické simulace analogů nukleotidů nukleových kyselin
Michal Růžička -
Nízkoúrovňová optimalizace algoritmů komprese a dekomprese silového pole
Tomáš Raček -
Molekulární simulace proteinů
Matyáš SUCHÝ -
Vliv silného elektrického pole na strukturu polymerů ve vodných roztocích
Šárka DĚDIČOVÁ -
Analýza chování silových polí při simulacích DNA aRNA
Ivana Velikovská -
Viry a jejich role v evoluci organismů
Kristína Rovňáková
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Složky
Soubory
MARKLOVÁ, E.
6. 5. 2023