Surveillance bakteriální kmenů produkujících širokospektrou beta-laktamázu.

Bc. Martina VLASOVÁ

Master's thesis

Surveillance of bacterial strains producing broad-spectrum beta-lactamase.

Abstract:

V úvodní části mé diplomové práce se zaměřuji na zmapování problematiky spojené s antibiotickou terapií a následným rozvojem antibiotické rezistence. Sledování rezistence se zakládá především na sběru dat a vyhodnocování výsledků stanovených citlivostí z celého světa. Antibiotická rezistence je přirozený jev, který se uplatňuje v evoluci mikrobů jako jeden z mechanismů adaptace na nové podmínky v prostředí. Na závěr teoretické části jsem popsala českou i evropskou legislativu a nástroje pro kontrolu výskytu antibiotické rezistence. Pro tuto práce jsem si zvolila výzkumnou otázku, zda se výskyt ESBL kmenů v Nemocnici České Budějovice a.s. v čase zvyšuje a zda jsou tyto hodnoty srovnatelné s hodnotami dosaženými v moravských nemocnicích. Jedná se o Fakultní nemocnici Olomouc, Fakultní nemocnici Ostrava a Krajskou nemocnici T. Bati ve Zlíně. Sběr dat jsem prováděla ve spolupráci s laborantkami a lékaři v laboratoři Bakteriologie Nemocnice České Budějovice a.s. Bakterie testované na průkaz produkce ESBL pocházely z biologických materiálů pacientů Nemocnice České Budějovice a.s. Prvním cílem bylo porovnání výsledků v Nemocnici České Budějovice a.s. v čase, a bylo zaměřeno na období 2007 ? 2012. Pokud se zaměřím na celkový počet ESBL kmenů, které byly izolovány od roku 2007, mají hodnoty vzestupnou tendenci. Zatímco v roce 2007 bylo zjištěno jen 64 kmenů o rok později se počet více než zdvojnásobil. V roce 2010 se hodnoty vyšplhaly na 281 kmenů a ve sledovaném roce 2012 dosáhl počet na 321 kmenů. Výskyt ESBL kmenů se od roku 2007 navýšil asi pětkrát. Kromě zvyšující se tendence lze z dlouhodobého hlediska říci, že se výrazně změnilo spektrum výskytu jednotlivých druhů v produkci ESBL. V roce 2007 to byly kmeny K. pneumoniae, které dominovaly statistikám, ale postupem času se do popředí dostávaly kmeny E. coli. Hodnoty z roku 2012 ale ukazují, že výskyt ESBL kmenů K. pneumoniae je opět téměř srovnatelný s počtem kmenů E. coli. Druhým cílem bylo porovnat výsledky z roku 2012 se studií Prevalence ESBL-pozitivních enterobakterií ve velkých moravských nemocnicích. V celkovém přehledu všech producentů ESBL jsou hodnoty nemocnice České Budějovice (5,23 %) srovnatelné s hodnotami v Ostravě (4,9 %) a ve Zlíně (4,3 %). Počet kmenů v nemocnici v Olomouci je oproti Č. Budějovicím asi dvakrát vyšší (11,8 %). České Budějovice se v tomto porovnání řadí spíše k nemocnicím s nižším výskytem ESBL producentů. Nemocnice České Budějovice a.s. se nachází pod celorepublikovým průměrem, což vychází z jejího propracovaného systému péče o pacienty s kolonizací nebo infekcí ESBL kmeny a ze systému kontroly antibiotické terapie pomocí antibiotického střediska. Tyto výsledky mohou sloužit Nemocnici České Budějovice ke statistickým účelům a také k návrhům na zlepšování péče o pacienty. V diskuzi jsem poukázala na nebezpečí šíření rezistentních kmenů bakterií v komunitě a s tím spojené nebezpečí při závažných nebo hromadných haváriích. V těchto případech může skrz otevřené rány postižených vnikat do těla řada infektů včetně ESBL producentů. Na rozdíl od běžných citlivých bakterií nejsou tyto citlivé k běžně používaným antibiotikům a tím ohrožují životy lidí postižených havárií.

Abstract:

In the first part of my thesis I focus on mapping problems associated with antibiotic therapy and subsequent development of antibiotic resistance. Tracking resistance is based primarily on data collection and evaluation of the results set sensitivity from around the world. Antibiotic resistance is a natural phenomenon that can be observed in the evolution of microbes as one of the mechanisms of adaptation to new conditions in the environment. For this work I have chosen the following research questions. Do the incidence of ESBL strains in the České Budějovice Hospital a.s. increase over time? Are these values comparable to those achieved in another region, namely in Moravian hospitals the University Hospital of Olomouc, Ostrava University Hospital and Regional University Hospital of T. Bata in Zlin? The data collection I made in collaboration with the laboratory technicians and doctors at Hospital?s Bacteriology Laboratory in České Budějovice. Bacteries tested for the detection of ESBL production originated from biological materials, witch came from patients of hospital in České Budějovice. The first objective was to compare the results achieved in the České Budějovice Hospital in the period of 2007 to 2012. If we look at the total number of ESBL strains that have been isolated since 2007, values have upward trend. While in 2007 there were only 64 strains a year later, the number more than doubled. In 2010, the value soared to 281 tribes and in the year 2012, the number was 321 tribes. The incidence of ESBL strains in 2007 increased about five times. In the long term we can say the numbers have increasing tendency and the range of each species in the production of ESBL has significantly changed. In 2007, it was K. pneumoniae strains that dominated the statistics, but over time the strains of E. coli came forefront. Values of 2012 suggest that the presence of ESBL strains of K. pneumoniae is again almost equal to the number of E. coli strains. The second objective was to compare the results of the 2012 with study of the Prevalence of ESBL-positive Enterobacteriaceae in large Moravian hospitals. In the general overview of ESBL producers values in Hospital České Budějovice (5.23%) are comparable to those in Ostrava (4.9%) and in Zlín (4.3%). Number of strains in the Hospital in Olomouc (11.8%) is about twice as high as the numbers in České Budějovice. In this comparison the České Budějovice Hospital is one of the hospitals with a lower incidence of ESBL producers. The České Budějovice Hospital is below the national average, which originate from an elaborate system of care for patients with colonization or infection with ESBL strains, and from therapy control system using antibiotic center. These results may serve to the Hospital in České Budějovice for statistical purposes, and also for proposals for improving patient care. In the discussion, I pointed out the danger of the spread of resistant strains of bacteria in the community and also the associated risks that mentioned bacteria mean for patients injured in mass accidents or disasters. In these cases, number of infections including ESBL producers can penetrate through open wounds into the affected body. Unlike conventional sensitive bacteria those strains are resistant to commonly used antibiotics and thereby endanger the lives of people affected by the accident.

Keywords

bakteriální rezistence, širokospektrá beta-laktamáza, polytrauma, antibiotická léčba, hromadná havárie

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 21. 5. 2013

Accessible from:: 21. 5. 2013

Thesis defence

• Supervisor: doc. Dr. Friedo Zölzer, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Studies

Master programme / field:
Protection of Inhabitants / Civil Emergency Readiness