Strukturní studium mikrobiálních lektinů

Bc. Martin Kollár

Diplomová práce

Structural studies of microbial lectins

Abstract:

This diploma thesis deals with the study of selected PLU1 lectin from Photorhabdus laumondii subsp. laumondii. The work aims to find the optimal crystallization conditions and to characterize the properties of this lectin by various biophysical and other methods. The activity of the prepared lectin was tested by hemagglutination and subsequently the specificity of the lectin towards the selected saccharides was examined by hemagglutination inhibition assay. Structural stability of PLU1 was characterized by dynamic light scattering and differential scanning fluorimetry. Based on the results, an optimized crystallization procedure was designed, and crystallization experiments were performed.

Abstract:

Táto diplomová práca sa venuje štúdiu vybraného lektínu PLU1 z baktérie Photorhabdus laumondii subsp. laumondii. Práca sa zameriava na nájdenie optimálnych kryštalizačných podmienok a na charakterizáciu vlastností tohto lektínu pomocou rôznych biofyzikálnych a iných metód. Aktivita pripraveného lektínu bola testovaná pomocou hemaglutinácie a následne bola skúmaná špecifita lektínu k vybraným sacharidom pomocou inhibičných testov hemaglutinácie. Stabilita PLU1 zo štruktúrneho hľadiska bola charakterizovaná pomocou merania dynamického rozptylu svetla a diferenciálnej skenovacej fluorimetrie. Na základe výsledkov bol navrhnutý optimalizovaný postup pre kryštalizáciu a boli prevedené kryštalizačné experimenty.

Klíčová slova

PLU1, lektín, kryštalografia, Photorhabdus, hemaglutinácia, inhibícia, lectin, crystallography, hemagglutination, inhibition

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2019
• Vedoucí: Mgr. Josef Houser, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie