MOŽNOSTI ANALÝZY VÝSLEDKŮ MULTIPLOVÝCH METOD PRO STANOVENÍ SPECIFICKÝCH IgE

Eliška FRANTOVÁ

Bakalářská práce

Possibilities of analysis of results of multiple methods for determination of specific IgE

Anotace:

Trendem v diagnostice alergických onemocnění jsou především multiplexové metody, které umožňují vyšetřit široký panel alergenů z malého množství pacientského séra. Interpretace výsledků je ovšem velice náročná. Aplikací procesů strojové analýzy na rozsáhlou databázi výsledků testu ImmunoCAP ISAC byla zjištěna korelace mezi alergeny, u nichž jsem následně nalezla i značnou homologii. Homologie byla důsledkem náležitosti alergenů ke stejným proteinovým rodinám. V případech, kdy alergeny nenáležely do stejné proteinové rodiny a nezjistila jsem u nich homologii, ale přesto byla naměřena korelace, jsem zjistila, že cross-reaktivita mezi těmito alergeny se uskutečňuje přes cukernou složku CCD. Lze předpokládat, že implementace strojového učení ulehčí interpretaci výsledků získaných pomocí multiplexových metod.

Abstract:

Trending in the diagnosis of allergic diseases are mainly multiplex methods, which allow examination of a wide panel of allergens from a small amount of patient serum. However, interpreting the results is very difficult. By applying machine analysis processes to the extensive ImmunoCAP ISAC assay results database, a correlation was found between allergens, in which I also found significant homology as a result of allergens belonging to the same protein families. In cases where the allergens did not belong to the same protein family and I did not find any homology, but the correlation was measured, I found that the cross-reactivity between these allergens takes place via the CCD sugar component. It can be assumed that the implementation of machine learning will facilitate the interpretation of results obtained by using multiplex methods.

Klíčová slova

Multiplexové metody, ImmunoCAP ISAC, strojové učení, alergie, alergeny

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2020

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Bc. Tomáš Vlas

ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI

Fakulta zdravotnických studií

Bakalářský studijní program / obor:
Specializace ve zdravotnictví / Zdravotní laborant