Studium celkového proteomu květu a vybraných proteinů interagujících s brassinosteroidy u modelové rostliny Arabidopsis Thaliana

Bc. Lucie JEŘÁBKOVÁ

Diplomová práce

Study of complete proteome of the flower part and selected proteins interacting with brassinosteroids within a model plant Arabidopsis Thaliana

Anotace:

Diplomová práce se zabývá proteomickou analýzou rostlinného zeleného materiálu Arabidopsis Thaliana a květů vybraných odrůd Pisum Sativum se zaměřením na proteiny interagující s brassinosteroidy. Brassinosteroidy jsou rostlinné hormony, které hrají klíčovou roli v regulaci růstu a vývoje rostlin. Práce shrnuje informace o signální dráze, biosyntéze a mechanismu účinku brassinosteroidů. Zaměřuje se na souhrn proteomických metod a následnou bioinformatickou analýzou dat. Experimentální část diplomové práce zahrnuje optimalizaci metod k extrakci proteinů, štěpení proteinů a přečištění peptidů s následnou analýzou tandemové hmotnostní spektrometrie. Výsledky poskytují informace počtu a proteinů a peptidů v jednotlivých vzorcích. Mapování proteinových identifikací poskytuje informaci o přítomných proteinech v zeleném materiálu Arabidopsis Thaliana a květů Pisum Sativum.

Abstract:

The thesis focuses on the proteomic analysis of plant green material from Arabidopsis thaliana and flowers of selected varieties of Pisum sativum, with an emphasis on proteins interacting with brassinosteroids. Brassinosteroids are plant hormones that play a key role in regulating plant growth and development. The thesis summarizes information about the signaling pathway, biosynthesis, and mechanism of action of brassinosteroids. It focuses on a summary of proteomic methods and subsequent bioinformatics analysis of the data. The experimental part of the thesis includes the optimization of methods for protein extraction, protein digestion, and peptide purification, followed by tandem mass spectrometry analysis. The results provide information on the number and types of proteins and peptides in individual samples. Protein identification mapping provides information on the proteins present in the green material of Arabidopsis thaliana and the flowers of Pisum sativum.

Klíčová slova

Arabidopsis Thaliana, Pisum Sativum, brassinosteroidy, proteiny, proteomika, hmotnostní spektrometrie

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 8. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. René Lenobel, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie rostlin / Experimentální biologie rostlin