Fylogeneze a sekvenování topotypového materiálu rodu Bujurquina

Bc. Kateřina BOUBERLOVÁ

Diplomová práce

Anotace:

Bujurquina je nejrozšířenějším a druhově nejbohatším rodem cichlidů v západní Amazonii Jižní Ameriky, avšak na základě nedávných studií zůstává málo známý. V této práci, založené na analýzách molekulárních dat (marker mtDNA cytochromu b), je poskytnuta nová fylogenetická hypotéza pro tento rod, spolu s přehledem jeho druhové rozmanitosti a biogeografickou interpretací jeho evoluce. Celkem bylo do této práce zahrnuto 45 taxonů na úrovni druhu, z toho 20 platných druhů (z 21) a 25 potenciálních nových druhů. Pro 25 druhů a 17 potenciálních nových druhů byly vygenerovány nové sekvence. Většina zahrnutých druhů a potenciálních nových druhů byla potvrzena molekulárními analýzami. Fylogeneze tohoto rodu je dobře vyřešená a dobře podporovaná. Vysoký stupeň endemismu v rodu Bujurquina je potvrzen a rozšířen do všech povodí jeho rozšíření. Vysoký endemismus spolu s dobře vyřešenou a dobře podporovanou fylogenezí umožnil velmi podrobnou biogeografickou rekonstrukci tohoto rodu, což potvrzuje a dokonce významně rozšiřuje naše znalosti o biogeografické evoluci západní Amazonie a západní Jižní Ameriky.

Abstract:

Bujurquina is the most widespread and species-rich genus of cichlids in the western Amazon of South America, yet based on recent studies it remains poorly known. In this thesis, based on analyses of molecular data (mtDNA cytochrome b marker) a new phylogenetic hypothesis for the genus is provided, with a review of its species diversity, and biogeographic interpretation of its evolution. In this thesis a total of 45 species-level taxa were included, including 20 valid species (out of 21) and 25 putative new species. New sequences were generated for 25 species and 17 putative new species. Most of the included species and putative new species are confirmed by the molecular analyses. The phylogeny of the genus is well resolved and well supported. A high degree of endemism in Bujurquina is confirmed and extended to all basins of its distribution. The high endemism together with the well resolved and well supported phylogeny enabled a very detailed biogeographic reconstruction of the genus which confirms and even significantly extends our knowledge of the biogeographical evolution of the Western Amazon and Western South America.

Klíčová slova

Bujurquina, fylogeneze, sekvenování, Cichlidy, Cichlids, Cichlidae, vrubozubcovití, Jižní Amerika, Amazonie, Amazonka, biogeografie, cytochrom b, cytb, endemit, druhová diverzita, fylogenetické analýzy, diverzita, evoluce, Peru, Ekvádor

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 4. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. Mgr. Oldřich Říčan, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Učitelství pro střední školy / Učitelství pro střední školy se specializací biologie - Učitelství pro střední školy se specializací informatika