Detekce DNA vazebných proteinů na nabitých rozhraních

Bc. Lenka Zámečníková

Bakalářská práce

Detection of the DNA-binding proteins at charged interfaces

Anotace:

V této bakalářské práci se věnujeme studiu elektrochemických odezev histonů a jejich oktameru s využitím chronopotenciometrické rozpouštěcí analýzy v kombinaci s adsorpční přenosovou metodou a rtuťovou elektrodou modifikovanou DTT. Histony byly pro studium vybrány pro své aminokyselinové složení s větším obsahem lysinu, argininu a histidinu, které jsou zároveň elektroaktivní. Naše výsledky ukazují odlišné elektrochemické chování jednotlivých histonů (resp. oktameru) na pozitivně a negativně nabitém povrchu elektrody. Vliv účinků elektrického pole byl podrobněji zkoumán pro histon H2A a oktamer histonů, které byly vystaveny působení elektrického pole o různé intenzitě a po různě dlouhý čas. Odlišné elektrochemické chování bylo pozorováno pravděpodobně díky různé velikosti těchto proteinů. Naše výsledky doplňují poznatky o elektrochemickém chování proteinů na nabitých površích a zároveň tato měření tvoří základ pro další analýzu interakcí s DNA.

Abstract:

In this thesis we study histones and histone octamer electrochemical responses using chronopotentiometric stripping analysis combined with adsorptive stripping transfer method and DTT-modified mercury electrode. Histones were chosen for their amino acid composition with greater lysine, arginine and histidine content. These amino acids are also electroactive. Our results show different electrochemical behaviour of individual histones (respectively octamer) at positively and negatively charged electrode surface. Electric field effects were investigated in more detail for histone H2A and histone octamer by exposure to an electric field of varying intensity and for different exposure time. Different electrochemical responses were observed probably due to the different size of these proteins. Our results complement knowledge about electrochemical behaviour of the proteins at the charged surfaces. These measurements also form the basis for further analysis of histone-DNA interactions.

Klíčová slova

histony, chronopotenciometrie konstantním proudem, elektrochemická analýza, rtuťová elektroda

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 25. 6. 2019
• Vedoucí: RNDr. Veronika Ostatná, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie