Porovnání metod izolace a detekce virů z pitné a užitkové vody

Bc. Jakub Hrdý

Master's thesis

Comparison between methods to isolate and detect viruses from drinking water and water for industrial purposes

Anotácia:

Šíření virů způsobujících alimentární infekce nejčastěji probíhá prostřednictvím mezilidského kontaktu, významný podíl na jejich šíření má však i přenos prostřednictvím kontaminované vody, která může být následně zdrojem sekundárních kontaminací potravin. Metody pro izolaci a detekci virů tak hrají klíčovou roli při průkazu těchto patogenů a při stanovení případných rizik, která se pojí s užíváním pitné a užitkové vody. Testování vod na přítomnost virových patogenů nepatří mezi standardně prováděné procedury, což spolu s nedostatkem standardizovaných protokolů pro izolaci a detekci různých skupin virů z vodního prostředí představuje problém a může vést k podcenění případných rizik. Různé přístupy jsou navíc často úzce aplikovatelné, a proto je zapotřebí optimalizovat metody pro daný typ vod a konkrétní virové agens. Tato práce je věnovaná problematice izolačních a detekčních metod virů z pitné a užitkové vody. Klade za cíl uvést přehled v současnosti nejpoužívanějších metod pro citlivou izolaci a následnou detekci virových částic z různých typů vod a experimentálně ověřit použitelnost a účinnost některých z těchto metod.

Abstract:

The spread of foodborne viruses occurs most often through interpersonal contact. A significant share of their transmission has, however, transmission through contaminated water which can then be additionally a source of a secondary contamination of food. The methods for the isolation and detection of these viruses play a key role in detection of these pathogens and in determination of the potential risks that are associated with use of potable and industrial water. Testing the waters for the presence of viral pathogens is not a standard procedure, which together with the lack of standardized protocols for the isolation and the detection of various groups of viruses from aquatic environments poses a problem and may lead to a significant underestimation of the potential risks. Various approaches are moreover often narrowly applicable, and thus it is necessary to optimize the method for the specific matrix and viral agents. This thesis is focused on the isolation and the detection methods of the viruses from drinking and industrial water. Therefore its aims are to provide an overview of the currently most widely used methods for sensitive detection and subsequent isolation of viral particles from different water types and to experimentally verify the applicability and effectiveness of some of these methods.

Kľúčové slová

virus, voda, izolace, detekce, water, isolation, detection

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 6. 2015
• Vedúci: Mgr. Petra Vašíčková

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology