Úložiště programů pro výuku bioinformatiky na FI MU

Bc. Jiří Kyjovský

Bakalářská práce

Software repository for teaching bioinformatics at FI MU

Anotace:

K výuce bioinformatiky na Fakultě informatiky Masarykovy Univerzity je používán stárnoucí virtuální stroj Bio-Linux obsahující sadu bioinformatických nástrojů, který je potřeba nahradit. Cílem bakalářské práce je navržení a vytvoření softwarového repozitáře, který bude použit k uložení bioinformatických nástrojů nutných pro potřeby výuky. Takto vytvořený repozitář a programy v něm uložené mohou být nasazeny na nový virtuální stroj, který by nahradil zastaralý Bio-Linux. Bakalářská práce se skládá z návrhu, ve kterém jsou popsány nároky na úložiště programů a nástroje, jenž umožní implementaci celého systému. Na něj navazuje implementační část, která uvádí realizaci návrhu a jeho nasazení k vytvoření úložiště programů.

Abstract:

The aging Bio-Linux virtual machine containing bioinformatics tools is used to teach bioinformatics at the Faculty of Informatics of Masaryk University and needs to be replaced. The bachelor thesis aims to design and create a software repository that will be used to store the bioinformatics tools needed for teaching. The created repository and the stored programs in it can be deployed on a new virtual machine to replace the obsolete Bio-Linux. The bachelor thesis consists of a proposal describing the requirements for the software repository and the tools that will allow the implementation of the entire system. This is followed by an implementation chapter introducing the design's realization and deployment to create the software repository.

Klíčová slova

softwarový repozitář, balení softwaru, Copr, Packit, Git

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 26. 6. 2023
• Vedoucí: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Jan Kasprzak, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Informatika / Informatika