In silico predikce vazebných vlastností lektinu RS20L – Bc. Michal Ďurech, Ph.D.
Bc. Michal Ďurech, Ph.D.
Diplomová práce
In silico predikce vazebných vlastností lektinu RS20L
In silico prediction of lectin RS20L binding properties
Abstract:
This thesis is focused on in silico prediction of binding properties of Ralstonia solanacearum lectin RS20L by means of molecular docking and molecular dynamics simulations. In lectin RS20L there were identified two types of binding sites probably with different sugar specificity. Three water molecules were found in a groove binding site which could mediate saccharide binding to the lectin structure …víceAbstract:
Táto práca bola zameraná na in silico štúdium väzbových vlastností lektínu RS20L metódou molekulárneho dokovania a simuláciou molekulovej dynamiky. Lektín obsahuje dva typy väzbových miest, ktoré sa pravdepodobne líšia v sacharidovej špecifite. V žliabkovom mieste boli identifikované tri molekuly vody, ktoré by potenciálne mohli sprostredkovať interakciu medzi lektínom a sacharidom, z ktorých dve boli …více
Jazyk práce: slovenština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2011
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/bok7q/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 8. 6. 2011
- Vedoucí: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie
Práce na příbuzné téma
-
Reaction mechanisms of glycosyltransferases studied by Ab Initio molecular dynamics
Pavel Janoš -
Nucleation of water and argon in supersonic molecular beams by the molecular dynamics method
Martin Klíma -
Three dimensional structure determination of a biopolymer using molecular dynamics and experimental restraints measured in isotropic media and oriented phases
Josef Chmelík -
Time-reversible predictors in molecular dynamics
Jiří Janek -
Molecular dynamics simulation of Uncoupling Protein 5
Denis Ivanov -
Optimization of Molecular Dynamics Forcefields via Machine Learning
Patrik Kula -
Molecular dynamics simulation of Uncoupling Protein 4
Alicia Holmes -
Computational tools for the analysis of biomolecular data obtained by NMR and molecular dynamics simulations
Petr Novák