Bc. Viktorie Koksová

Bakalářská práce

Srovnání identifikace genů antibiotické resistence z whole-metagenome sekvenování a resistomapu.

Comparison of WMGS ARG genes identification and resistomap.
Anotace:
V této bakalářské práci se věnujeme srovnávání nástrojů pro identifikaci genů antibiotické rezistence v metagenomových datech. V teoretické části shrnujeme poznatky týkající se biologického a bioinformatického kontextu. Představíme si zde především pojmy metagenom, antibiotická rezistence a gen antibiotické rezistence a dále nástroje, se kterými budeme pracovat: pro sestavení metagenomu jsou to MEGAHIT …více
Abstract:
In this bachelor thesis we compare tools for the identification of antibiotic resistance genes in metagenome data. In the theoretical part, we summarize the findings regarding the biological and bioinformatics context. In particular, we introduce the concepts of metagenome, antibiotic resistance and antibiotic resistance gene, as well as the tools we will work with: for metagenome assembly these are …více
 

Klíčová slova

Antibiotická rezistence Antibiotika Bioinformatické nástroje Geny antibiotické rezistence Identifikace genů Metagenomová data Sekvenace DNA Antibiotic resistance Antibiotics Bioinformatics tools Antibiotic resistance genes Gene identification Metagenomic data DNA sequencing
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2024
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/css6r/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 20. 6. 2024
  • Vedoucí: Ing. Vojtěch Bartoň
  • Oponent: Mgr. Soňa Smetanová, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce