Bc. Viktorie Koksová

Bachelor's thesis

Srovnání identifikace genů antibiotické resistence z whole-metagenome sekvenování a resistomapu.

Comparison of WMGS ARG genes identification and resistomap.
Abstract:
V této bakalářské práci se věnujeme srovnávání nástrojů pro identifikaci genů antibiotické rezistence v metagenomových datech. V teoretické části shrnujeme poznatky týkající se biologického a bioinformatického kontextu. Představíme si zde především pojmy metagenom, antibiotická rezistence a gen antibiotické rezistence a dále nástroje, se kterými budeme pracovat: pro sestavení metagenomu jsou to MEGAHIT …more
Abstract:
In this bachelor thesis we compare tools for the identification of antibiotic resistance genes in metagenome data. In the theoretical part, we summarize the findings regarding the biological and bioinformatics context. In particular, we introduce the concepts of metagenome, antibiotic resistance and antibiotic resistance gene, as well as the tools we will work with: for metagenome assembly these are …more
 

Keywords

Antibiotická rezistence Antibiotika Bioinformatické nástroje Geny antibiotické rezistence Identifikace genů Metagenomová data Sekvenace DNA Antibiotic resistance Antibiotics Bioinformatics tools Antibiotic resistance genes Gene identification Metagenomic data DNA sequencing
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2024
Identifier: https://is.muni.cz/th/css6r/

Thesis defence

  • Date of defence: 20. 6. 2024
  • Supervisor: Ing. Vojtěch Bartoň
  • Reader: Mgr. Soňa Smetanová, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution