Vliv kovů na vazebné vlastnosti lektinů

Bc. Anna Ondráčková

Bachelor's thesis

Influence of ions on binding properties of lectines

Anotácia:

V této práci jsou předmětem studia proteiny PA-IIL pocházející z bakterie Pseudomonas aeruginosa a BC2L-A pocházející z bakterie Burkholderia cenopacia, v jejichž vazebných místech se nacházejí dva vápenaté ionty podílející se na vazbě se sacharidem. Cílem práce bylo odebrat tyto vápenaté ionty z vazebného místa lektinů, nahradit je jinými dvojmocnými kovovými ionty a poté měřit jejich aktivitu a vazebné vlastnosti pomocí izotermální titrační kalorimetrie a rezonance povrchového plasmonu. Bakalářská práce navazuje na předchozí studium lektinů BC2L-A a PA-IIL, patřící do nadrodiny PA-IIL, společně s lektiny CV-IIL a RS-IIL, které vykazují podobný vazebný charakter. Bakalářská práce obsahuje kromě literární rešerše i metodiku a výsledky, které popisují produkci proteinů BC2L-A a PA-IIL, odebírání vápenatých iontů z jejich struktury, jejich inkubaci s jinými kovovými ionty a následné měření jejich aktivity a vazebných vlastností.

Abstract:

The object of the study are proteins PA-IIL from bacteria Pseudomonas aeruginosa and BC2L-A from bacteria Burkholderia cenopacia, in whose binding site there are two calcium ions, that mediate binding between the lectin and a sacharide. The goal of this work is to remove these two calcium ions from the protein's binding site, replace them with other metal ions and then measure their activity and binding properties through isotermal titration calorimetry and surface plasmon resonance. The bachelor thesis follows the previous works on the BC2L-A and PA-IIL lectins, belonging in the PA-IIL family, along with lectins of a similar binding character, CV-IIL and RS-IIL. Bachelor thesis consists of literary review and metodology and results, which describe the production of the BC2L-A and PA-IIL proteins, the removal of calcium ions from their binding site, their incubation in solutions of other metal ions and subsequent measurement of their activity and binding properties.

Kľúčové slová

lektin, PA-IIL, BC2L-A, kovy, vazebné vlastnosti, lectin, metals, binding properties

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 6. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2015
• Vedúci: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry