Telomerový protein TIN2 a jeho interakce při ochraně konců lidských chromosomů

Bc. Denisa Horáková

Diplomová práce

Telomeric TIN2 interactions in shelterin of human chromosome ends

Anotace:

Telomery jsou nukleoproteinové struktury lokalizované na koncích eukaryotických chromozomů. Po každém buněčném dělení dochází ke zkracování telomer. Telomeráza je enzym, který připojuje nukleotidy ke koncům telomerové DNA a je tedy schopný odvrátit zkracování telomer v rychle se množících buňkách, včetně rakovinových. Na regulaci aktivity telomerázy se podílí shelterin. Shelterin je komplex šesti různých proteinových podjednotek, který chrání telomery před degradací DNA, rekombinací a fúzí chromozomálních konců. Shelterinové proteiny TRF1 a TRF2 přímo nasedají na dvouřetězcovou DNA. Protein TIN2 je centrálním proteinem shelterinu, který přispívá k udržení celkové struktury a zajištění hlavních funkcí shelterinu. Tato práce se soustředí na charakterizaci vlivu lidského telomerového proteinu TIN2 na vazbu TRF1 a TRF2 na telomerovou DNA. Všechny kvantitativní experimenty byly provedeny in vitro za pomoci fluorescenční anizotropie a gelové retardační elektroforézy.

Abstract:

Telomeres are nucleoprotein structures located at the ends of eukaryotic chromosomes. After each cell division, telomeres shorten. Telomerase is an enzyme which adds nucleotides to the ends of telomeric DNA. Telomerase thus reverts telomere shortening in fast dividing cells including cancer cells. Protein complex shelterin regulates the activity of telomerase. Shelterin is a complex of six protein subunits that protects telomeres from DNA degradation, recombination, and fusion of chromosomal ends. Shelterin proteins TRF1 and TRF2 directly bind to double-stranded DNA. The central protein of shelterin is TIN2 which maintains the overall structure and ensures the main functions of shelterin. This work focuses on the characterization of the influence of human telomeric protein TIN2 on the binding of TRF1 and TRF2 to telomeric DNA. All quantitative binding experiments have been performed in vitro using fluorescence anisotropy and electrophoretic mobility shift assay.

Keywords

DNA, telomera, shelterin, TIN2, TRF1, TRF2, telomere

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 1. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 2. 2018
• Vedoucí: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Genomika a proteomika