Izolace a charakterizace potenciálního lektinu z Adenanthera pavonina

Bc. Žaneta Svobodová

Master's thesis

Isolation and characterization of potential lectin from Adenanthera pavonina

Anotácia:

Lektiny jsou proteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá izolací a charakterizací potenciálního lektinu z rostliny Adenanthera pavonina – APPL. Protein APPL byl získán jednoduchou extrakcí ze slupek semen rostliny Adenanthera pavonina. Pomocí „glycan array“ bylo zjištěno, že protein APPL je pravděpodobně specifický k L-rhamnose, ale afinita APPL k tomuto sacharidu je pravděpodobně nízká. Pomocí analytické ultracentrifugace a hmotnostní spektrometrie bylo zjištěno, že APPL je monomer o molekulové hmotnosti 27,58 kDa. Pomocí hmotnostní spektrometrie byla rovněž získána značná část sekvence proteinu APPL, a tyto úseky velmi dobře odpovídají sekvencím lektinů patřících do skupinu lektinů podobných chitinasam.

Abstract:

Lectins are multivalent proteins of non-immune origin which recognize and bind reversibly diverse sugar structures. This thesis deals with the isolation and characterization of a potential lectin from the plant Adenanthera pavonina – APPL. The APPL protein was obtained by simple extraction from the peels of seeds of the Adenanthera pavonina. Using the glycan array, the APPL protein was found to be probably L-rhamnose specific, but the affinity of APPL for this saccharide is low. Analytical ultracentrifugation and mass spectrometry showed that APPL is a monomeric protein of molecular mass 27.58 kDa. Parts of the APPL protein sequence were also obtained by mass spectrometry, and these parts correspond very well to lectins sequences belonging to the chitinase related lectin family.

Kľúčové slová

lektin, luštěnina, Adenanthera pavonina, sacharid, vazba, specifita, lectin, legume, carbohydrate, bond, specificity

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2019
• Vedúci: Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biomolecular Chemistry