Fylogeneze a taxonomie vybraných druhů sinic čeledi Merismopediaceae s využitím metody single cell sequencing

Bc. Jan POKORNÝ

Bachelor's thesis

Abstract:

Díky novým molekulárním metodám, které byly použity pro revizi mnohých tradičních taxonů sinic, se vyjasňují jejich skutečné systematické pozice. Merismopediaceae je poměrně málo zkoumaná skupina sinic, a proto její mnohé podskupiny nebyly dostatečně molekulárně revidovány. V této práci byly použity standardní molekulární metody polyfázického přístupu jak na environmentální izoláty taxonů náležících čeledi Merismopeidaceae, tak na kmeny v kultuře. Následná fylogenetická analýza založená na genu 16S rRNA odhaluje polyfyletismus rodů Merismopedia a Eucapsis. Tato práce rovněž obsahuje vůbec první molekulární analýzu rodu Microcrocis.

Abstract:

Thanks to new molecular methods, which have been used for revision of many traditional cyanobacterial taxa, their real systematic positions have become clearer. Merismopediaceae is a relatively understudied group of Cyanobacteria, therefore many subordinate taxa have not been sufficiently molecularly reviewed. In this thesis standard molecular methods of the polyphasic approach were used on environmental isolates as well as cultured strains of Merismopediaceae taxa. Subsequent phylogeny analysis based on 16S rRNA gene shows the polyplyly of genera Merismopedia and Eucapsis. The thesis also includes the very first molecular evidence of the taxonomic position of the genus Microcrocis.

Keywords

Algologie, sinice, single cell sequencing, fylogeneze, tvorba kolonie, mikrokapilární izolace, polyfyletismus, konvergentní evoluce, postavení tylakoidů, transmisní elektronová mikroskopie

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 4. 2022

Thesis defence

• Date of defence: 23. 5. 2022
• Supervisor: prof. RNDr. Jan Kaštovský, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Biology