LongRNAs jako prognostické biomarkery u meningiomů

Bc. Tereza VIRGLOVÁ

Diplomová práce

LongRNAs as prognostic biomarkers in meningiomas

Anotace:

MEG3 je imprintovaný gen, nacházející se na chromozomu 14, který kóduje přibližně 1,6 kb lncRNA. LncRNA jsou stabilní v tělních tekutinách a zapojeny do mnoha buněčných procesů. Mají důležitou roli ve vývoji různých nádorových onemocnění, například meningiomů - nádorů pocházejících z mozkových plen. Meningiomy jsou známé svou rekurencí, dokonce i benigních forem, v průběhu 5 až 10 let. Gen MEG3 je možné detekovat pomocí RNA in situ hybridizace (RISH). Metoda RISH se jeví jako vhodná metoda pro analýzu lokalizace a míry exprese MEG3. V diplomové práci byly zjištěny signifikantní rozdíly ve tvorbě klastrů transkriptu MEG3 při porovnání rekurentních a nerekurentních pacientů, avšak metoda zatím není vhodná pro použití v klinické praxi jako predikce prognózy. Bylo potvrzeno, že s vyšším WHO gradem stoupá riziko rekurence, avšak nebyla nalezena žádná spojitost mezi MEG3 a WHO gradem z hlediska míry exprese a lokalizace.

Abstract:

MEG3 is a imprinted gene, localized on chromosome 14, that encodes the lncRNA containing approximately 1.6 kbs. LncRNA are stable in body fluids and they are involved in many cellular processes. They play an important role in the development of various cancers, for example meningiomas - tumors arising from meninges. Meningiomas can recur even from their benign forms during the time period from 5 to 10 years. The aim of this work was detection and analysis of MEG3 transcripts by RNA in situ hybridisation (RISH) and investigation of the localization and expression of MEG3. Significant differences between recurrent and non-recurrent patients have been found in creation of clusters of MEG3 transcripts. However, the method is still not suitable for the utility in clinical prognostication of meningioma recurrence. Additionally, it was confirmed that the risk of recurrence increases with higher WHO grade, but there is no relationship between WHO grade and the MEG3 expression and localization.

Klíčová slova

MEG3, meningiomy, lncRNAs

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Hanuš Slavík

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Chemie / Bioorganická chemie a chemická biologie